Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Length 2,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCM1Q15154 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCM1Q15154 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PCM1Q15154 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCM1Q15154 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCM1Q15154 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCM1Q15154 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCM1Q15154 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCM1Q15154 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCM1Q15154 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PCM1Q15154 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCM1Q15154 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCM1Q15154 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCM1Q15154 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCM1Q15154 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCM1Q15154 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCM1Q15154 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCM1Q15154 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCM1Q15154 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCM1Q15154 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCM1Q15154 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCM1Q15154 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCM1Q15154 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PCM1Q15154 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCM1Q15154 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCM1Q15154 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCM1Q15154 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCM1Q15154 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCM1Q15154 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCM1Q15154 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCM1Q15154 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PCM1Q15154 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCM1Q15154 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCM1Q15154 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCM1Q15154 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCM1Q15154 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCM1Q15154 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCM1Q15154 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCM1Q15154 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCM1Q15154 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCM1Q15154 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCM1Q15154 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCM1Q15154 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCM1Q15154 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCM1Q15154 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PCM1Q15154 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCM1Q15154 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCM1Q15154 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCM1Q15154 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCM1Q15154 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCM1Q15154 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCM1Q15154 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCM1Q15154 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCM1Q15154 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCM1Q15154 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCM1Q15154 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCM1Q15154 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PCM1Q15154 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCM1Q15154 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCM1Q15154 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCM1Q15154 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCM1Q15154 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCM1Q15154 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCM1Q15154 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCM1Q15154 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCM1Q15154 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCM1Q15154 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCM1Q15154 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCM1Q15154 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCM1Q15154 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCM1Q15154 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCM1Q15154 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCM1Q15154 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCM1Q15154 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCM1Q15154 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCM1Q15154 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCM1Q15154 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCM1Q15154 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCM1Q15154 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCM1Q15154 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCM1Q15154 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCM1Q15154 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCM1Q15154 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCM1Q15154 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCM1Q15154 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCM1Q15154 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCM1Q15154 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCM1Q15154 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCM1Q15154 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCM1Q15154 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PCM1Q15154 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCM1Q15154 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCM1Q15154 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCM1Q15154 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCM1Q15154 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCM1Q15154 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCM1Q15154 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCM1Q15154 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCM1Q15154 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCM1Q15154 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms