Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PRKD1Q15139 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKD1Q15139 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKD1Q15139 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKD1Q15139 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PRKD1Q15139 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKD1Q15139 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRKD1Q15139 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRKD1Q15139 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRKD1Q15139 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKD1Q15139 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKD1Q15139 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRKD1Q15139 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKD1Q15139 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRKD1Q15139 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PRKD1Q15139 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRKD1Q15139 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKD1Q15139 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKD1Q15139 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKD1Q15139 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKD1Q15139 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRKD1Q15139 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKD1Q15139 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKD1Q15139 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKD1Q15139 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRKD1Q15139 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKD1Q15139 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKD1Q15139 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKD1Q15139 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKD1Q15139 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRKD1Q15139 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKD1Q15139 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKD1Q15139 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKD1Q15139 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRKD1Q15139 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKD1Q15139 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKD1Q15139 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKD1Q15139 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRKD1Q15139 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRKD1Q15139 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRKD1Q15139 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKD1Q15139 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRKD1Q15139 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKD1Q15139 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKD1Q15139 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKD1Q15139 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRKD1Q15139 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKD1Q15139 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKD1Q15139 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKD1Q15139 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRKD1Q15139 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKD1Q15139 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRKD1Q15139 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKD1Q15139 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRKD1Q15139 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKD1Q15139 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRKD1Q15139 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKD1Q15139 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRKD1Q15139 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKD1Q15139 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKD1Q15139 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKD1Q15139 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKD1Q15139 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRKD1Q15139 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PRKD1Q15139 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKD1Q15139 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRKD1Q15139 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKD1Q15139 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRKD1Q15139 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKD1Q15139 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKD1Q15139 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKD1Q15139 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKD1Q15139 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKD1Q15139 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRKD1Q15139 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRKD1Q15139 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKD1Q15139 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRKD1Q15139 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKD1Q15139 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKD1Q15139 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKD1Q15139 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRKD1Q15139 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKD1Q15139 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRKD1Q15139 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKD1Q15139 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKD1Q15139 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKD1Q15139 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKD1Q15139 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRKD1Q15139 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRKD1Q15139 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKD1Q15139 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKD1Q15139 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRKD1Q15139 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKD1Q15139 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRKD1Q15139 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKD1Q15139 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKD1Q15139 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRKD1Q15139 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKD1Q15139 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PRKD1Q15139 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
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