Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERC3Q15034 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERC3Q15034 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERC3Q15034 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERC3Q15034 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC3Q15034 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC3Q15034 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC3Q15034 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC3Q15034 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC3Q15034 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERC3Q15034 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC3Q15034 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC3Q15034 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC3Q15034 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC3Q15034 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC3Q15034 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC3Q15034 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERC3Q15034 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERC3Q15034 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERC3Q15034 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HERC3Q15034 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HERC3Q15034 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERC3Q15034 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERC3Q15034 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERC3Q15034 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERC3Q15034 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERC3Q15034 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC3Q15034 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC3Q15034 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERC3Q15034 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERC3Q15034 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC3Q15034 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC3Q15034 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC3Q15034 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERC3Q15034 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERC3Q15034 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERC3Q15034 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERC3Q15034 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERC3Q15034 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERC3Q15034 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC3Q15034 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC3Q15034 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC3Q15034 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC3Q15034 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC3Q15034 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC3Q15034 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERC3Q15034 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERC3Q15034 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERC3Q15034 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERC3Q15034 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC3Q15034 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC3Q15034 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC3Q15034 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC3Q15034 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC3Q15034 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC3Q15034 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC3Q15034 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC3Q15034 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC3Q15034 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERC3Q15034 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERC3Q15034 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERC3Q15034 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERC3Q15034 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC3Q15034 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC3Q15034 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC3Q15034 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC3Q15034 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC3Q15034 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC3Q15034 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC3Q15034 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC3Q15034 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERC3Q15034 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERC3Q15034 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HERC3Q15034 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERC3Q15034 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERC3Q15034 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERC3Q15034 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC3Q15034 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC3Q15034 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC3Q15034 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HERC3Q15034 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERC3Q15034 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HERC3Q15034 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC3Q15034 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC3Q15034 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HERC3Q15034 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC3Q15034 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC3Q15034 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC3Q15034 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HERC3Q15034 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HERC3Q15034 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERC3Q15034 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERC3Q15034 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HERC3Q15034 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC3Q15034 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC3Q15034 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HERC3Q15034 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HERC3Q15034 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HERC3Q15034 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HERC3Q15034 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
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