Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NCAPD2Q15021 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NCAPD2Q15021 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NCAPD2Q15021 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NCAPD2Q15021 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NCAPD2Q15021 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NCAPD2Q15021 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NCAPD2Q15021 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NCAPD2Q15021 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NCAPD2Q15021 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NCAPD2Q15021 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NCAPD2Q15021 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NCAPD2Q15021 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NCAPD2Q15021 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NCAPD2Q15021 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NCAPD2Q15021 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NCAPD2Q15021 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NCAPD2Q15021 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NCAPD2Q15021 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NCAPD2Q15021 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NCAPD2Q15021 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NCAPD2Q15021 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NCAPD2Q15021 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NCAPD2Q15021 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NCAPD2Q15021 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NCAPD2Q15021 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NCAPD2Q15021 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
NCAPD2Q15021 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
NCAPD2Q15021 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NCAPD2Q15021 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NCAPD2Q15021 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NCAPD2Q15021 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NCAPD2Q15021 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NCAPD2Q15021 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NCAPD2Q15021 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NCAPD2Q15021 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NCAPD2Q15021 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NCAPD2Q15021 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NCAPD2Q15021 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NCAPD2Q15021 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NCAPD2Q15021 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NCAPD2Q15021 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NCAPD2Q15021 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NCAPD2Q15021 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NCAPD2Q15021 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NCAPD2Q15021 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
NCAPD2Q15021 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NCAPD2Q15021 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NCAPD2Q15021 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
NCAPD2Q15021 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
NCAPD2Q15021 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NCAPD2Q15021 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NCAPD2Q15021 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NCAPD2Q15021 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NCAPD2Q15021 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NCAPD2Q15021 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NCAPD2Q15021 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NCAPD2Q15021 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NCAPD2Q15021 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NCAPD2Q15021 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NCAPD2Q15021 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NCAPD2Q15021 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NCAPD2Q15021 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NCAPD2Q15021 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NCAPD2Q15021 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NCAPD2Q15021 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NCAPD2Q15021 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NCAPD2Q15021 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NCAPD2Q15021 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NCAPD2Q15021 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NCAPD2Q15021 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NCAPD2Q15021 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NCAPD2Q15021 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NCAPD2Q15021 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NCAPD2Q15021 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
NCAPD2Q15021 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NCAPD2Q15021 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NCAPD2Q15021 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NCAPD2Q15021 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NCAPD2Q15021 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NCAPD2Q15021 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NCAPD2Q15021 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms