Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLCA4Q14CN2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLCA4Q14CN2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCA4Q14CN2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCA4Q14CN2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCA4Q14CN2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCA4Q14CN2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCA4Q14CN2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CLCA4Q14CN2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLCA4Q14CN2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLCA4Q14CN2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCA4Q14CN2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCA4Q14CN2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCA4Q14CN2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCA4Q14CN2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCA4Q14CN2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLCA4Q14CN2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CLCA4Q14CN2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLCA4Q14CN2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCA4Q14CN2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCA4Q14CN2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCA4Q14CN2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCA4Q14CN2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCA4Q14CN2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCA4Q14CN2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCA4Q14CN2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCA4Q14CN2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLCA4Q14CN2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLCA4Q14CN2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLCA4Q14CN2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLCA4Q14CN2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLCA4Q14CN2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLCA4Q14CN2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLCA4Q14CN2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLCA4Q14CN2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLCA4Q14CN2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLCA4Q14CN2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLCA4Q14CN2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLCA4Q14CN2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLCA4Q14CN2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLCA4Q14CN2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLCA4Q14CN2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLCA4Q14CN2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCA4Q14CN2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCA4Q14CN2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCA4Q14CN2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCA4Q14CN2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCA4Q14CN2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCA4Q14CN2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCA4Q14CN2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCA4Q14CN2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCA4Q14CN2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCA4Q14CN2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCA4Q14CN2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCA4Q14CN2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms