Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLCA4Q14CN2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLCA4Q14CN2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCA4Q14CN2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCA4Q14CN2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCA4Q14CN2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCA4Q14CN2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCA4Q14CN2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CLCA4Q14CN2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLCA4Q14CN2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLCA4Q14CN2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCA4Q14CN2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCA4Q14CN2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCA4Q14CN2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCA4Q14CN2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCA4Q14CN2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLCA4Q14CN2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CLCA4Q14CN2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLCA4Q14CN2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCA4Q14CN2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCA4Q14CN2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCA4Q14CN2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCA4Q14CN2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCA4Q14CN2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCA4Q14CN2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCA4Q14CN2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCA4Q14CN2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLCA4Q14CN2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLCA4Q14CN2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLCA4Q14CN2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLCA4Q14CN2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLCA4Q14CN2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLCA4Q14CN2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLCA4Q14CN2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLCA4Q14CN2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLCA4Q14CN2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLCA4Q14CN2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLCA4Q14CN2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLCA4Q14CN2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLCA4Q14CN2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLCA4Q14CN2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLCA4Q14CN2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CLCA4Q14CN2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLCA4Q14CN2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLCA4Q14CN2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCA4Q14CN2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCA4Q14CN2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCA4Q14CN2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCA4Q14CN2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCA4Q14CN2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCA4Q14CN2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCA4Q14CN2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCA4Q14CN2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCA4Q14CN2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCA4Q14CN2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCA4Q14CN2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCA4Q14CN2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLCA4Q14CN2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
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