Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSPNQ14714 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SSPNQ14714 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SSPNQ14714 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SSPNQ14714 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSPNQ14714 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSPNQ14714 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSPNQ14714 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSPNQ14714 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SSPNQ14714 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SSPNQ14714 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSPNQ14714 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSPNQ14714 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SSPNQ14714 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSPNQ14714 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSPNQ14714 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSPNQ14714 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SSPNQ14714 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSPNQ14714 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSPNQ14714 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSPNQ14714 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SSPNQ14714 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSPNQ14714 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSPNQ14714 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SSPNQ14714 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSPNQ14714 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSPNQ14714 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSPNQ14714 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SSPNQ14714 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSPNQ14714 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSPNQ14714 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSPNQ14714 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSPNQ14714 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSPNQ14714 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSPNQ14714 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSPNQ14714 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSPNQ14714 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSPNQ14714 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSPNQ14714 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SSPNQ14714 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SSPNQ14714 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSPNQ14714 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSPNQ14714 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSPNQ14714 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSPNQ14714 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSPNQ14714 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SSPNQ14714 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SSPNQ14714 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SSPNQ14714 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SSPNQ14714 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SSPNQ14714 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SSPNQ14714 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SSPNQ14714 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SSPNQ14714 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SSPNQ14714 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SSPNQ14714 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSPNQ14714 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSPNQ14714 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSPNQ14714 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSPNQ14714 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSPNQ14714 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSPNQ14714 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSPNQ14714 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SSPNQ14714 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSPNQ14714 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSPNQ14714 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSPNQ14714 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSPNQ14714 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSPNQ14714 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSPNQ14714 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSPNQ14714 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSPNQ14714 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSPNQ14714 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSPNQ14714 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SSPNQ14714 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSPNQ14714 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSPNQ14714 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSPNQ14714 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSPNQ14714 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSPNQ14714 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSPNQ14714 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSPNQ14714 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSPNQ14714 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSPNQ14714 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSPNQ14714 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSPNQ14714 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSPNQ14714 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSPNQ14714 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSPNQ14714 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SSPNQ14714 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSPNQ14714 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSPNQ14714 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSPNQ14714 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSPNQ14714 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSPNQ14714 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSPNQ14714 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSPNQ14714 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSPNQ14714 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SSPNQ14714 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SSPNQ14714 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
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