Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HNF4GQ14541 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HNF4GQ14541 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HNF4GQ14541 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HNF4GQ14541 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HNF4GQ14541 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HNF4GQ14541 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HNF4GQ14541 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HNF4GQ14541 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HNF4GQ14541 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HNF4GQ14541 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HNF4GQ14541 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HNF4GQ14541 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HNF4GQ14541 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HNF4GQ14541 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HNF4GQ14541 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HNF4GQ14541 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HNF4GQ14541 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HNF4GQ14541 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HNF4GQ14541 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HNF4GQ14541 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HNF4GQ14541 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HNF4GQ14541 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HNF4GQ14541 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HNF4GQ14541 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HNF4GQ14541 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HNF4GQ14541 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HNF4GQ14541 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HNF4GQ14541 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HNF4GQ14541 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HNF4GQ14541 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HNF4GQ14541 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HNF4GQ14541 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HNF4GQ14541 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HNF4GQ14541 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HNF4GQ14541 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HNF4GQ14541 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HNF4GQ14541 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HNF4GQ14541 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HNF4GQ14541 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HNF4GQ14541 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HNF4GQ14541 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HNF4GQ14541 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HNF4GQ14541 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HNF4GQ14541 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HNF4GQ14541 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HNF4GQ14541 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HNF4GQ14541 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HNF4GQ14541 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HNF4GQ14541 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HNF4GQ14541 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HNF4GQ14541 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HNF4GQ14541 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HNF4GQ14541 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HNF4GQ14541 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HNF4GQ14541 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HNF4GQ14541 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HNF4GQ14541 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HNF4GQ14541 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HNF4GQ14541 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HNF4GQ14541 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HNF4GQ14541 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HNF4GQ14541 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HNF4GQ14541 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HNF4GQ14541 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HNF4GQ14541 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HNF4GQ14541 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HNF4GQ14541 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HNF4GQ14541 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HNF4GQ14541 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HNF4GQ14541 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HNF4GQ14541 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HNF4GQ14541 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HNF4GQ14541 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HNF4GQ14541 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HNF4GQ14541 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HNF4GQ14541 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HNF4GQ14541 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HNF4GQ14541 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HNF4GQ14541 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HNF4GQ14541 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HNF4GQ14541 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HNF4GQ14541 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HNF4GQ14541 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HNF4GQ14541 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HNF4GQ14541 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HNF4GQ14541 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HNF4GQ14541 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HNF4GQ14541 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
HNF4GQ14541 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HNF4GQ14541 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HNF4GQ14541 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HNF4GQ14541 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HNF4GQ14541 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HNF4GQ14541 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HNF4GQ14541 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HNF4GQ14541 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HNF4GQ14541 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HNF4GQ14541 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HNF4GQ14541 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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