Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPRIN1Q14444 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAPRIN1Q14444 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPRIN1Q14444 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPRIN1Q14444 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPRIN1Q14444 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPRIN1Q14444 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPRIN1Q14444 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPRIN1Q14444 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPRIN1Q14444 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPRIN1Q14444 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPRIN1Q14444 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPRIN1Q14444 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPRIN1Q14444 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPRIN1Q14444 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPRIN1Q14444 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPRIN1Q14444 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPRIN1Q14444 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPRIN1Q14444 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPRIN1Q14444 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPRIN1Q14444 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPRIN1Q14444 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPRIN1Q14444 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPRIN1Q14444 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPRIN1Q14444 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPRIN1Q14444 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPRIN1Q14444 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPRIN1Q14444 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPRIN1Q14444 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPRIN1Q14444 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPRIN1Q14444 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPRIN1Q14444 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPRIN1Q14444 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPRIN1Q14444 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPRIN1Q14444 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPRIN1Q14444 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPRIN1Q14444 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPRIN1Q14444 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPRIN1Q14444 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPRIN1Q14444 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPRIN1Q14444 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPRIN1Q14444 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPRIN1Q14444 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPRIN1Q14444 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPRIN1Q14444 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPRIN1Q14444 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPRIN1Q14444 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPRIN1Q14444 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPRIN1Q14444 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPRIN1Q14444 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPRIN1Q14444 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPRIN1Q14444 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPRIN1Q14444 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPRIN1Q14444 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPRIN1Q14444 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPRIN1Q14444 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPRIN1Q14444 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPRIN1Q14444 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPRIN1Q14444 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPRIN1Q14444 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPRIN1Q14444 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPRIN1Q14444 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPRIN1Q14444 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPRIN1Q14444 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPRIN1Q14444 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPRIN1Q14444 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPRIN1Q14444 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPRIN1Q14444 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPRIN1Q14444 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPRIN1Q14444 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPRIN1Q14444 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPRIN1Q14444 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPRIN1Q14444 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPRIN1Q14444 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPRIN1Q14444 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPRIN1Q14444 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPRIN1Q14444 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPRIN1Q14444 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPRIN1Q14444 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPRIN1Q14444 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPRIN1Q14444 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPRIN1Q14444 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPRIN1Q14444 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPRIN1Q14444 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPRIN1Q14444 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPRIN1Q14444 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPRIN1Q14444 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPRIN1Q14444 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPRIN1Q14444 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPRIN1Q14444 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPRIN1Q14444 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPRIN1Q14444 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPRIN1Q14444 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPRIN1Q14444 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPRIN1Q14444 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPRIN1Q14444 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPRIN1Q14444 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPRIN1Q14444 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPRIN1Q14444 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPRIN1Q14444 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
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