Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE1CQ14123 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE1CQ14123 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE1CQ14123 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDE1CQ14123 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE1CQ14123 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE1CQ14123 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDE1CQ14123 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDE1CQ14123 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE1CQ14123 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE1CQ14123 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE1CQ14123 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDE1CQ14123 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE1CQ14123 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE1CQ14123 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDE1CQ14123 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDE1CQ14123 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE1CQ14123 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDE1CQ14123 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE1CQ14123 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE1CQ14123 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDE1CQ14123 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDE1CQ14123 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDE1CQ14123 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDE1CQ14123 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE1CQ14123 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE1CQ14123 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
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