Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NID2Q14112 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NID2Q14112 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NID2Q14112 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NID2Q14112 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NID2Q14112 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NID2Q14112 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NID2Q14112 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NID2Q14112 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NID2Q14112 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NID2Q14112 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NID2Q14112 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NID2Q14112 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NID2Q14112 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NID2Q14112 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NID2Q14112 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NID2Q14112 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NID2Q14112 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NID2Q14112 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NID2Q14112 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NID2Q14112 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
NID2Q14112 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NID2Q14112 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NID2Q14112 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NID2Q14112 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NID2Q14112 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NID2Q14112 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
NID2Q14112 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NID2Q14112 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NID2Q14112 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NID2Q14112 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NID2Q14112 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NID2Q14112 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NID2Q14112 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NID2Q14112 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NID2Q14112 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NID2Q14112 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NID2Q14112 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NID2Q14112 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NID2Q14112 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NID2Q14112 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NID2Q14112 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NID2Q14112 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NID2Q14112 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NID2Q14112 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NID2Q14112 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NID2Q14112 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NID2Q14112 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NID2Q14112 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NID2Q14112 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NID2Q14112 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NID2Q14112 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NID2Q14112 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NID2Q14112 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NID2Q14112 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
NID2Q14112 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NID2Q14112 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NID2Q14112 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NID2Q14112 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NID2Q14112 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NID2Q14112 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NID2Q14112 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NID2Q14112 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NID2Q14112 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
NID2Q14112 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NID2Q14112 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NID2Q14112 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NID2Q14112 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NID2Q14112 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NID2Q14112 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NID2Q14112 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NID2Q14112 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NID2Q14112 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NID2Q14112 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NID2Q14112 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NID2Q14112 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NID2Q14112 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NID2Q14112 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
NID2Q14112 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NID2Q14112 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
NID2Q14112 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
NID2Q14112 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NID2Q14112 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NID2Q14112 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NID2Q14112 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
NID2Q14112 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NID2Q14112 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NID2Q14112 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NID2Q14112 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NID2Q14112 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NID2Q14112 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NID2Q14112 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NID2Q14112 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NID2Q14112 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NID2Q14112 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
NID2Q14112 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NID2Q14112 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NID2Q14112 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NID2Q14112 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NID2Q14112 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
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