Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CIRBPQ14011 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CIRBPQ14011 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CIRBPQ14011 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CIRBPQ14011 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms