Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CKAP5Q14008 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CKAP5Q14008 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CKAP5Q14008 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CKAP5Q14008 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CKAP5Q14008 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CKAP5Q14008 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CKAP5Q14008 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CKAP5Q14008 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CKAP5Q14008 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CKAP5Q14008 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CKAP5Q14008 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CKAP5Q14008 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CKAP5Q14008 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CKAP5Q14008 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CKAP5Q14008 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CKAP5Q14008 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CKAP5Q14008 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CKAP5Q14008 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CKAP5Q14008 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CKAP5Q14008 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CKAP5Q14008 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CKAP5Q14008 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CKAP5Q14008 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CKAP5Q14008 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CKAP5Q14008 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CKAP5Q14008 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CKAP5Q14008 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CKAP5Q14008 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CKAP5Q14008 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CKAP5Q14008 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CKAP5Q14008 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CKAP5Q14008 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CKAP5Q14008 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CKAP5Q14008 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CKAP5Q14008 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CKAP5Q14008 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CKAP5Q14008 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CKAP5Q14008 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CKAP5Q14008 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CKAP5Q14008 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CKAP5Q14008 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CKAP5Q14008 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CKAP5Q14008 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CKAP5Q14008 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CKAP5Q14008 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CKAP5Q14008 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CKAP5Q14008 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CKAP5Q14008 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CKAP5Q14008 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CKAP5Q14008 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CKAP5Q14008 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CKAP5Q14008 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CKAP5Q14008 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CKAP5Q14008 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CKAP5Q14008 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CKAP5Q14008 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CKAP5Q14008 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CKAP5Q14008 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CKAP5Q14008 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CKAP5Q14008 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CKAP5Q14008 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CKAP5Q14008 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CKAP5Q14008 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CKAP5Q14008 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CKAP5Q14008 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CKAP5Q14008 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CKAP5Q14008 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CKAP5Q14008 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CKAP5Q14008 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CKAP5Q14008 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CKAP5Q14008 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CKAP5Q14008 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CKAP5Q14008 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CKAP5Q14008 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CKAP5Q14008 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CKAP5Q14008 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CKAP5Q14008 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CKAP5Q14008 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CKAP5Q14008 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CKAP5Q14008 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CKAP5Q14008 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CKAP5Q14008 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CKAP5Q14008 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CKAP5Q14008 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CKAP5Q14008 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CKAP5Q14008 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CKAP5Q14008 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CKAP5Q14008 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CKAP5Q14008 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CKAP5Q14008 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CKAP5Q14008 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CKAP5Q14008 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CKAP5Q14008 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CKAP5Q14008 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CKAP5Q14008 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CKAP5Q14008 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CKAP5Q14008 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CKAP5Q14008 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CKAP5Q14008 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms