Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SNTB1Q13884 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNTB1Q13884 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNTB1Q13884 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNTB1Q13884 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNTB1Q13884 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNTB1Q13884 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNTB1Q13884 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNTB1Q13884 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNTB1Q13884 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNTB1Q13884 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNTB1Q13884 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNTB1Q13884 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNTB1Q13884 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNTB1Q13884 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNTB1Q13884 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNTB1Q13884 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNTB1Q13884 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNTB1Q13884 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNTB1Q13884 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNTB1Q13884 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SNTB1Q13884 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SNTB1Q13884 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNTB1Q13884 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNTB1Q13884 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNTB1Q13884 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNTB1Q13884 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNTB1Q13884 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNTB1Q13884 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNTB1Q13884 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNTB1Q13884 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNTB1Q13884 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNTB1Q13884 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SNTB1Q13884 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SNTB1Q13884 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SNTB1Q13884 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNTB1Q13884 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNTB1Q13884 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNTB1Q13884 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNTB1Q13884 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNTB1Q13884 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNTB1Q13884 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNTB1Q13884 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SNTB1Q13884 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNTB1Q13884 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNTB1Q13884 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNTB1Q13884 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNTB1Q13884 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNTB1Q13884 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNTB1Q13884 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNTB1Q13884 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SNTB1Q13884 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNTB1Q13884 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNTB1Q13884 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNTB1Q13884 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNTB1Q13884 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNTB1Q13884 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNTB1Q13884 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNTB1Q13884 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SNTB1Q13884 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNTB1Q13884 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SNTB1Q13884 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNTB1Q13884 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNTB1Q13884 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNTB1Q13884 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNTB1Q13884 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNTB1Q13884 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNTB1Q13884 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNTB1Q13884 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNTB1Q13884 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNTB1Q13884 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNTB1Q13884 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNTB1Q13884 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNTB1Q13884 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNTB1Q13884 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNTB1Q13884 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNTB1Q13884 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNTB1Q13884 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNTB1Q13884 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNTB1Q13884 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNTB1Q13884 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNTB1Q13884 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNTB1Q13884 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNTB1Q13884 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNTB1Q13884 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNTB1Q13884 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SNTB1Q13884 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNTB1Q13884 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNTB1Q13884 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNTB1Q13884 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNTB1Q13884 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNTB1Q13884 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNTB1Q13884 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNTB1Q13884 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNTB1Q13884 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNTB1Q13884 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNTB1Q13884 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNTB1Q13884 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNTB1Q13884 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNTB1Q13884 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.5 ms