Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PKP1Q13835 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
PKP1Q13835 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PKP1Q13835 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PKP1Q13835 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PKP1Q13835 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PKP1Q13835 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PKP1Q13835 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PKP1Q13835 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PKP1Q13835 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PKP1Q13835 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PKP1Q13835 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PKP1Q13835 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PKP1Q13835 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PKP1Q13835 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PKP1Q13835 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PKP1Q13835 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PKP1Q13835 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PKP1Q13835 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PKP1Q13835 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PKP1Q13835 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PKP1Q13835 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PKP1Q13835 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
PKP1Q13835 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PKP1Q13835 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PKP1Q13835 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PKP1Q13835 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
PKP1Q13835 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PKP1Q13835 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PKP1Q13835 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PKP1Q13835 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PKP1Q13835 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PKP1Q13835 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PKP1Q13835 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PKP1Q13835 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PKP1Q13835 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PKP1Q13835 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PKP1Q13835 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PKP1Q13835 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PKP1Q13835 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PKP1Q13835 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PKP1Q13835 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PKP1Q13835 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PKP1Q13835 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PKP1Q13835 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PKP1Q13835 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PKP1Q13835 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PKP1Q13835 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PKP1Q13835 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PKP1Q13835 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PKP1Q13835 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PKP1Q13835 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PKP1Q13835 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PKP1Q13835 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PKP1Q13835 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PKP1Q13835 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PKP1Q13835 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PKP1Q13835 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PKP1Q13835 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PKP1Q13835 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PKP1Q13835 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PKP1Q13835 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PKP1Q13835 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PKP1Q13835 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PKP1Q13835 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PKP1Q13835 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PKP1Q13835 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PKP1Q13835 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PKP1Q13835 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PKP1Q13835 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PKP1Q13835 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PKP1Q13835 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PKP1Q13835 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PKP1Q13835 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PKP1Q13835 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PKP1Q13835 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PKP1Q13835 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PKP1Q13835 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PKP1Q13835 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PKP1Q13835 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PKP1Q13835 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PKP1Q13835 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PKP1Q13835 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PKP1Q13835 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PKP1Q13835 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PKP1Q13835 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PKP1Q13835 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PKP1Q13835 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PKP1Q13835 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PKP1Q13835 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PKP1Q13835 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PKP1Q13835 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PKP1Q13835 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PKP1Q13835 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PKP1Q13835 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PKP1Q13835 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PKP1Q13835 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PKP1Q13835 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PKP1Q13835 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PKP1Q13835 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
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