Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
LAMC2Q13753 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LAMC2Q13753 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LAMC2Q13753 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LAMC2Q13753 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LAMC2Q13753 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LAMC2Q13753 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LAMC2Q13753 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
LAMC2Q13753 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LAMC2Q13753 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
LAMC2Q13753 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
LAMC2Q13753 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LAMC2Q13753 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LAMC2Q13753 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LAMC2Q13753 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LAMC2Q13753 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LAMC2Q13753 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LAMC2Q13753 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LAMC2Q13753 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LAMC2Q13753 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LAMC2Q13753 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
LAMC2Q13753 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
LAMC2Q13753 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMC2Q13753 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMC2Q13753 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LAMC2Q13753 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMC2Q13753 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMC2Q13753 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMC2Q13753 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMC2Q13753 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMC2Q13753 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMC2Q13753 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMC2Q13753 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LAMC2Q13753 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LAMC2Q13753 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LAMC2Q13753 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LAMC2Q13753 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LAMC2Q13753 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LAMC2Q13753 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LAMC2Q13753 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LAMC2Q13753 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMC2Q13753 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMC2Q13753 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMC2Q13753 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LAMC2Q13753 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMC2Q13753 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMC2Q13753 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMC2Q13753 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMC2Q13753 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMC2Q13753 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMC2Q13753 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMC2Q13753 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMC2Q13753 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMC2Q13753 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LAMC2Q13753 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LAMC2Q13753 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
LAMC2Q13753 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMC2Q13753 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMC2Q13753 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMC2Q13753 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMC2Q13753 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMC2Q13753 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LAMC2Q13753 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LAMC2Q13753 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LAMC2Q13753 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LAMC2Q13753 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LAMC2Q13753 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMC2Q13753 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMC2Q13753 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMC2Q13753 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMC2Q13753 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMC2Q13753 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMC2Q13753 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMC2Q13753 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LAMC2Q13753 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LAMC2Q13753 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMC2Q13753 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMC2Q13753 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMC2Q13753 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMC2Q13753 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMC2Q13753 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMC2Q13753 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMC2Q13753 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LAMC2Q13753 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LAMC2Q13753 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMC2Q13753 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMC2Q13753 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMC2Q13753 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
LAMC2Q13753 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LAMC2Q13753 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LAMC2Q13753 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LAMC2Q13753 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMC2Q13753 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMC2Q13753 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMC2Q13753 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMC2Q13753 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMC2Q13753 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMC2Q13753 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMC2Q13753 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMC2Q13753 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms