Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBA3CQ13748 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBA3CQ13748 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBA3CQ13748 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBA3CQ13748 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBA3CQ13748 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBA3CQ13748 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBA3CQ13748 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBA3CQ13748 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBA3CQ13748 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBA3CQ13748 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBA3CQ13748 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBA3CQ13748 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBA3CQ13748 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBA3CQ13748 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBA3CQ13748 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBA3CQ13748 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBA3CQ13748 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBA3CQ13748 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBA3CQ13748 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBA3CQ13748 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBA3CQ13748 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBA3CQ13748 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBA3CQ13748 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBA3CQ13748 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBA3CQ13748 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBA3CQ13748 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBA3CQ13748 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBA3CQ13748 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBA3CQ13748 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBA3CQ13748 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBA3CQ13748 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBA3CQ13748 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBA3CQ13748 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBA3CQ13748 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBA3CQ13748 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBA3CQ13748 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBA3CQ13748 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBA3CQ13748 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBA3CQ13748 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBA3CQ13748 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBA3CQ13748 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBA3CQ13748 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBA3CQ13748 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBA3CQ13748 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBA3CQ13748 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBA3CQ13748 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBA3CQ13748 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBA3CQ13748 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBA3CQ13748 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBA3CQ13748 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBA3CQ13748 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBA3CQ13748 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBA3CQ13748 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBA3CQ13748 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBA3CQ13748 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBA3CQ13748 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBA3CQ13748 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBA3CQ13748 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBA3CQ13748 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBA3CQ13748 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBA3CQ13748 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBA3CQ13748 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBA3CQ13748 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBA3CQ13748 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBA3CQ13748 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBA3CQ13748 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBA3CQ13748 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBA3CQ13748 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBA3CQ13748 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBA3CQ13748 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBA3CQ13748 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBA3CQ13748 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBA3CQ13748 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBA3CQ13748 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBA3CQ13748 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBA3CQ13748 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBA3CQ13748 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBA3CQ13748 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBA3CQ13748 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBA3CQ13748 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBA3CQ13748 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBA3CQ13748 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBA3CQ13748 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBA3CQ13748 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBA3CQ13748 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBA3CQ13748 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBA3CQ13748 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBA3CQ13748 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBA3CQ13748 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBA3CQ13748 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBA3CQ13748 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBA3CQ13748 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBA3CQ13748 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBA3CQ13748 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBA3CQ13748 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBA3CQ13748 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBA3CQ13748 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBA3CQ13748 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBA3CQ13748 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
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