Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CUL1Q13616 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CUL1Q13616 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CUL1Q13616 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CUL1Q13616 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CUL1Q13616 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CUL1Q13616 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CUL1Q13616 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CUL1Q13616 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CUL1Q13616 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CUL1Q13616 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CUL1Q13616 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CUL1Q13616 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CUL1Q13616 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CUL1Q13616 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CUL1Q13616 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CUL1Q13616 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CUL1Q13616 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CUL1Q13616 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CUL1Q13616 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CUL1Q13616 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CUL1Q13616 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CUL1Q13616 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CUL1Q13616 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CUL1Q13616 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CUL1Q13616 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CUL1Q13616 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CUL1Q13616 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CUL1Q13616 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CUL1Q13616 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CUL1Q13616 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CUL1Q13616 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CUL1Q13616 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUL1Q13616 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUL1Q13616 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUL1Q13616 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUL1Q13616 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUL1Q13616 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUL1Q13616 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUL1Q13616 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUL1Q13616 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CUL1Q13616 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CUL1Q13616 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CUL1Q13616 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CUL1Q13616 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CUL1Q13616 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CUL1Q13616 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CUL1Q13616 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CUL1Q13616 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CUL1Q13616 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CUL1Q13616 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CUL1Q13616 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CUL1Q13616 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CUL1Q13616 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CUL1Q13616 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CUL1Q13616 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CUL1Q13616 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CUL1Q13616 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CUL1Q13616 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CUL1Q13616 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CUL1Q13616 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CUL1Q13616 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CUL1Q13616 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CUL1Q13616 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CUL1Q13616 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CUL1Q13616 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CUL1Q13616 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CUL1Q13616 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CUL1Q13616 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CUL1Q13616 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CUL1Q13616 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CUL1Q13616 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CUL1Q13616 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CUL1Q13616 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CUL1Q13616 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CUL1Q13616 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CUL1Q13616 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CUL1Q13616 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CUL1Q13616 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CUL1Q13616 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CUL1Q13616 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CUL1Q13616 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CUL1Q13616 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CUL1Q13616 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CUL1Q13616 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CUL1Q13616 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CUL1Q13616 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CUL1Q13616 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CUL1Q13616 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CUL1Q13616 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CUL1Q13616 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CUL1Q13616 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CUL1Q13616 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CUL1Q13616 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CUL1Q13616 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CUL1Q13616 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CUL1Q13616 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CUL1Q13616 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CUL1Q13616 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CUL1Q13616 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
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