Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
IRF5Q13568 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
IRF5Q13568 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
IRF5Q13568 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
IRF5Q13568 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
IRF5Q13568 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
IRF5Q13568 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
IRF5Q13568 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
IRF5Q13568 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
IRF5Q13568 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
IRF5Q13568 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
IRF5Q13568 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
IRF5Q13568 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
IRF5Q13568 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
IRF5Q13568 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
IRF5Q13568 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
IRF5Q13568 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
IRF5Q13568 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
IRF5Q13568 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.45
IRF5Q13568 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
IRF5Q13568 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
IRF5Q13568 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
IRF5Q13568 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
IRF5Q13568 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
IRF5Q13568 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
IRF5Q13568 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
IRF5Q13568 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
IRF5Q13568 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
IRF5Q13568 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
IRF5Q13568 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
IRF5Q13568 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
IRF5Q13568 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
IRF5Q13568 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
IRF5Q13568 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
IRF5Q13568 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
IRF5Q13568 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
IRF5Q13568 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
IRF5Q13568 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
IRF5Q13568 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
IRF5Q13568 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
IRF5Q13568 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
IRF5Q13568 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
IRF5Q13568 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
IRF5Q13568 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
IRF5Q13568 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
IRF5Q13568 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
IRF5Q13568 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
IRF5Q13568 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
IRF5Q13568 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
IRF5Q13568 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
IRF5Q13568 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
IRF5Q13568 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
IRF5Q13568 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
IRF5Q13568 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
IRF5Q13568 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IRF5Q13568 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
IRF5Q13568 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
IRF5Q13568 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
IRF5Q13568 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
IRF5Q13568 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
IRF5Q13568 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
IRF5Q13568 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
IRF5Q13568 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
IRF5Q13568 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
IRF5Q13568 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
IRF5Q13568 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
IRF5Q13568 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
IRF5Q13568 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
IRF5Q13568 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
IRF5Q13568 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
IRF5Q13568 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IRF5Q13568 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IRF5Q13568 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
IRF5Q13568 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
IRF5Q13568 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IRF5Q13568 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
IRF5Q13568 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
IRF5Q13568 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
IRF5Q13568 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IRF5Q13568 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
IRF5Q13568 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
IRF5Q13568 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
IRF5Q13568 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IRF5Q13568 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
IRF5Q13568 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IRF5Q13568 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
IRF5Q13568 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IRF5Q13568 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IRF5Q13568 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
IRF5Q13568 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
IRF5Q13568 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
IRF5Q13568 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
IRF5Q13568 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
IRF5Q13568 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
IRF5Q13568 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
IRF5Q13568 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
IRF5Q13568 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
IRF5Q13568 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IRF5Q13568 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
IRF5Q13568 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
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