Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXE3Q13461 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXE3Q13461 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXE3Q13461 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXE3Q13461 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXE3Q13461 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXE3Q13461 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXE3Q13461 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXE3Q13461 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXE3Q13461 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXE3Q13461 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXE3Q13461 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FOXE3Q13461 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXE3Q13461 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FOXE3Q13461 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXE3Q13461 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXE3Q13461 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXE3Q13461 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXE3Q13461 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FOXE3Q13461 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXE3Q13461 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXE3Q13461 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXE3Q13461 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXE3Q13461 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FOXE3Q13461 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXE3Q13461 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXE3Q13461 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXE3Q13461 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXE3Q13461 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FOXE3Q13461 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXE3Q13461 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXE3Q13461 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXE3Q13461 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXE3Q13461 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXE3Q13461 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FOXE3Q13461 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXE3Q13461 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXE3Q13461 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXE3Q13461 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXE3Q13461 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXE3Q13461 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FOXE3Q13461 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FOXE3Q13461 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXE3Q13461 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXE3Q13461 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FOXE3Q13461 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXE3Q13461 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXE3Q13461 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXE3Q13461 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXE3Q13461 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FOXE3Q13461 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXE3Q13461 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXE3Q13461 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FOXE3Q13461 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXE3Q13461 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXE3Q13461 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXE3Q13461 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXE3Q13461 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXE3Q13461 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXE3Q13461 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXE3Q13461 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXE3Q13461 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXE3Q13461 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXE3Q13461 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXE3Q13461 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FOXE3Q13461 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXE3Q13461 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXE3Q13461 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXE3Q13461 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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