Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
MKRN4PQ13434 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
MKRN4PQ13434 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MKRN4PQ13434 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MKRN4PQ13434 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MKRN4PQ13434 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MKRN4PQ13434 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MKRN4PQ13434 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MKRN4PQ13434 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MKRN4PQ13434 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MKRN4PQ13434 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MKRN4PQ13434 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MKRN4PQ13434 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MKRN4PQ13434 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MKRN4PQ13434 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MKRN4PQ13434 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MKRN4PQ13434 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MKRN4PQ13434 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MKRN4PQ13434 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MKRN4PQ13434 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MKRN4PQ13434 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MKRN4PQ13434 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MKRN4PQ13434 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MKRN4PQ13434 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MKRN4PQ13434 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MKRN4PQ13434 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MKRN4PQ13434 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MKRN4PQ13434 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MKRN4PQ13434 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MKRN4PQ13434 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MKRN4PQ13434 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MKRN4PQ13434 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
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