Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLF1Q13351 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLF1Q13351 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLF1Q13351 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLF1Q13351 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLF1Q13351 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLF1Q13351 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLF1Q13351 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLF1Q13351 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLF1Q13351 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLF1Q13351 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLF1Q13351 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLF1Q13351 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLF1Q13351 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLF1Q13351 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLF1Q13351 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLF1Q13351 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLF1Q13351 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLF1Q13351 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLF1Q13351 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLF1Q13351 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLF1Q13351 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLF1Q13351 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLF1Q13351 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLF1Q13351 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLF1Q13351 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLF1Q13351 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLF1Q13351 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLF1Q13351 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLF1Q13351 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLF1Q13351 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KLF1Q13351 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KLF1Q13351 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLF1Q13351 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLF1Q13351 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLF1Q13351 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLF1Q13351 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLF1Q13351 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLF1Q13351 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLF1Q13351 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLF1Q13351 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLF1Q13351 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLF1Q13351 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLF1Q13351 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KLF1Q13351 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLF1Q13351 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLF1Q13351 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLF1Q13351 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLF1Q13351 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KLF1Q13351 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLF1Q13351 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLF1Q13351 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLF1Q13351 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLF1Q13351 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLF1Q13351 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLF1Q13351 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KLF1Q13351 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLF1Q13351 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KLF1Q13351 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLF1Q13351 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLF1Q13351 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLF1Q13351 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLF1Q13351 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLF1Q13351 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLF1Q13351 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLF1Q13351 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLF1Q13351 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLF1Q13351 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLF1Q13351 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLF1Q13351 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLF1Q13351 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KLF1Q13351 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KLF1Q13351 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KLF1Q13351 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KLF1Q13351 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLF1Q13351 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLF1Q13351 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLF1Q13351 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLF1Q13351 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLF1Q13351 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLF1Q13351 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLF1Q13351 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLF1Q13351 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLF1Q13351 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KLF1Q13351 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLF1Q13351 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLF1Q13351 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLF1Q13351 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLF1Q13351 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLF1Q13351 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLF1Q13351 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLF1Q13351 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLF1Q13351 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLF1Q13351 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLF1Q13351 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLF1Q13351 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLF1Q13351 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLF1Q13351 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLF1Q13351 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
KLF1Q13351 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
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