Protein–RNA interactions for Protein: Q13303

KCNAB2, Voltage-gated potassium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB2Q13303 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNAB2Q13303 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNAB2Q13303 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNAB2Q13303 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNAB2Q13303 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNAB2Q13303 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNAB2Q13303 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNAB2Q13303 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNAB2Q13303 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNAB2Q13303 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNAB2Q13303 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNAB2Q13303 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNAB2Q13303 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNAB2Q13303 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNAB2Q13303 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNAB2Q13303 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNAB2Q13303 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNAB2Q13303 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNAB2Q13303 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNAB2Q13303 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNAB2Q13303 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNAB2Q13303 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNAB2Q13303 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNAB2Q13303 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNAB2Q13303 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNAB2Q13303 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNAB2Q13303 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNAB2Q13303 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNAB2Q13303 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNAB2Q13303 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNAB2Q13303 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNAB2Q13303 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNAB2Q13303 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNAB2Q13303 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNAB2Q13303 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNAB2Q13303 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNAB2Q13303 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNAB2Q13303 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNAB2Q13303 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNAB2Q13303 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNAB2Q13303 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNAB2Q13303 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNAB2Q13303 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNAB2Q13303 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNAB2Q13303 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNAB2Q13303 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNAB2Q13303 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNAB2Q13303 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNAB2Q13303 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNAB2Q13303 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNAB2Q13303 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNAB2Q13303 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNAB2Q13303 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNAB2Q13303 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNAB2Q13303 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNAB2Q13303 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNAB2Q13303 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNAB2Q13303 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNAB2Q13303 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNAB2Q13303 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNAB2Q13303 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNAB2Q13303 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNAB2Q13303 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNAB2Q13303 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNAB2Q13303 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNAB2Q13303 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNAB2Q13303 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNAB2Q13303 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNAB2Q13303 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNAB2Q13303 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNAB2Q13303 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNAB2Q13303 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNAB2Q13303 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNAB2Q13303 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNAB2Q13303 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNAB2Q13303 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNAB2Q13303 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNAB2Q13303 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNAB2Q13303 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNAB2Q13303 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNAB2Q13303 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNAB2Q13303 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNAB2Q13303 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNAB2Q13303 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNAB2Q13303 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNAB2Q13303 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNAB2Q13303 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KCNAB2Q13303 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNAB2Q13303 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNAB2Q13303 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNAB2Q13303 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNAB2Q13303 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNAB2Q13303 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNAB2Q13303 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNAB2Q13303 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNAB2Q13303 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNAB2Q13303 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNAB2Q13303 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNAB2Q13303 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNAB2Q13303 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms