Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA3BQ13214 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SEMA3BQ13214 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SEMA3BQ13214 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA3BQ13214 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA3BQ13214 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEMA3BQ13214 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEMA3BQ13214 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEMA3BQ13214 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEMA3BQ13214 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SEMA3BQ13214 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEMA3BQ13214 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEMA3BQ13214 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEMA3BQ13214 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEMA3BQ13214 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEMA3BQ13214 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SEMA3BQ13214 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SEMA3BQ13214 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEMA3BQ13214 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEMA3BQ13214 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEMA3BQ13214 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEMA3BQ13214 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEMA3BQ13214 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEMA3BQ13214 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEMA3BQ13214 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEMA3BQ13214 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEMA3BQ13214 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEMA3BQ13214 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEMA3BQ13214 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEMA3BQ13214 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEMA3BQ13214 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEMA3BQ13214 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEMA3BQ13214 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEMA3BQ13214 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEMA3BQ13214 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEMA3BQ13214 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEMA3BQ13214 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEMA3BQ13214 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEMA3BQ13214 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEMA3BQ13214 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEMA3BQ13214 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEMA3BQ13214 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEMA3BQ13214 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEMA3BQ13214 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEMA3BQ13214 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA3BQ13214 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA3BQ13214 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA3BQ13214 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEMA3BQ13214 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEMA3BQ13214 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEMA3BQ13214 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEMA3BQ13214 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEMA3BQ13214 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEMA3BQ13214 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEMA3BQ13214 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEMA3BQ13214 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEMA3BQ13214 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEMA3BQ13214 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEMA3BQ13214 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SEMA3BQ13214 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEMA3BQ13214 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SEMA3BQ13214 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEMA3BQ13214 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEMA3BQ13214 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEMA3BQ13214 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEMA3BQ13214 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEMA3BQ13214 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEMA3BQ13214 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA3BQ13214 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA3BQ13214 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA3BQ13214 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA3BQ13214 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA3BQ13214 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA3BQ13214 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEMA3BQ13214 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEMA3BQ13214 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEMA3BQ13214 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEMA3BQ13214 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEMA3BQ13214 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEMA3BQ13214 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEMA3BQ13214 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEMA3BQ13214 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEMA3BQ13214 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEMA3BQ13214 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEMA3BQ13214 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEMA3BQ13214 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA3BQ13214 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA3BQ13214 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA3BQ13214 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA3BQ13214 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA3BQ13214 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA3BQ13214 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA3BQ13214 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA3BQ13214 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA3BQ13214 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA3BQ13214 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA3BQ13214 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA3BQ13214 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA3BQ13214 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA3BQ13214 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms