Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

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Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRIM32Q13049 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRIM32Q13049 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TRIM32Q13049 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TRIM32Q13049 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TRIM32Q13049 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRIM32Q13049 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRIM32Q13049 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRIM32Q13049 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRIM32Q13049 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRIM32Q13049 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRIM32Q13049 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRIM32Q13049 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRIM32Q13049 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRIM32Q13049 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRIM32Q13049 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRIM32Q13049 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRIM32Q13049 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRIM32Q13049 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRIM32Q13049 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIM32Q13049 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIM32Q13049 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIM32Q13049 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
TRIM32Q13049 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIM32Q13049 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRIM32Q13049 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM32Q13049 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM32Q13049 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM32Q13049 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM32Q13049 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM32Q13049 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM32Q13049 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRIM32Q13049 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM32Q13049 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM32Q13049 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM32Q13049 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM32Q13049 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM32Q13049 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM32Q13049 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM32Q13049 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM32Q13049 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM32Q13049 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM32Q13049 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM32Q13049 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM32Q13049 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRIM32Q13049 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRIM32Q13049 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRIM32Q13049 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRIM32Q13049 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRIM32Q13049 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRIM32Q13049 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRIM32Q13049 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
TRIM32Q13049 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRIM32Q13049 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRIM32Q13049 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TRIM32Q13049 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRIM32Q13049 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM32Q13049 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM32Q13049 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM32Q13049 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM32Q13049 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM32Q13049 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM32Q13049 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM32Q13049 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRIM32Q13049 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRIM32Q13049 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRIM32Q13049 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM32Q13049 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM32Q13049 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM32Q13049 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM32Q13049 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM32Q13049 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM32Q13049 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM32Q13049 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM32Q13049 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM32Q13049 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM32Q13049 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM32Q13049 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM32Q13049 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM32Q13049 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM32Q13049 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM32Q13049 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM32Q13049 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM32Q13049 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM32Q13049 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM32Q13049 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM32Q13049 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM32Q13049 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM32Q13049 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM32Q13049 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM32Q13049 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM32Q13049 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
TRIM32Q13049 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM32Q13049 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM32Q13049 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM32Q13049 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TRIM32Q13049 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM32Q13049 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM32Q13049 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM32Q13049 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
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