Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECH1Q13011 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECH1Q13011 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECH1Q13011 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECH1Q13011 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ECH1Q13011 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ECH1Q13011 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECH1Q13011 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECH1Q13011 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ECH1Q13011 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ECH1Q13011 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECH1Q13011 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECH1Q13011 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECH1Q13011 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECH1Q13011 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECH1Q13011 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECH1Q13011 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ECH1Q13011 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ECH1Q13011 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ECH1Q13011 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ECH1Q13011 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECH1Q13011 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECH1Q13011 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ECH1Q13011 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECH1Q13011 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECH1Q13011 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ECH1Q13011 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ECH1Q13011 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ECH1Q13011 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ECH1Q13011 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECH1Q13011 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ECH1Q13011 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ECH1Q13011 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms