Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSTF3Q12996 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CSTF3Q12996 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CSTF3Q12996 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CSTF3Q12996 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSTF3Q12996 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSTF3Q12996 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSTF3Q12996 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSTF3Q12996 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSTF3Q12996 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSTF3Q12996 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSTF3Q12996 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CSTF3Q12996 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSTF3Q12996 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CSTF3Q12996 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSTF3Q12996 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSTF3Q12996 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CSTF3Q12996 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CSTF3Q12996 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSTF3Q12996 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSTF3Q12996 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSTF3Q12996 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSTF3Q12996 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSTF3Q12996 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSTF3Q12996 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSTF3Q12996 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSTF3Q12996 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSTF3Q12996 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSTF3Q12996 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSTF3Q12996 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSTF3Q12996 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSTF3Q12996 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CSTF3Q12996 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSTF3Q12996 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSTF3Q12996 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSTF3Q12996 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSTF3Q12996 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CSTF3Q12996 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CSTF3Q12996 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSTF3Q12996 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSTF3Q12996 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSTF3Q12996 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSTF3Q12996 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CSTF3Q12996 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CSTF3Q12996 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CSTF3Q12996 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CSTF3Q12996 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSTF3Q12996 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSTF3Q12996 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CSTF3Q12996 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSTF3Q12996 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSTF3Q12996 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSTF3Q12996 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSTF3Q12996 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSTF3Q12996 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CSTF3Q12996 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSTF3Q12996 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSTF3Q12996 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CSTF3Q12996 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CSTF3Q12996 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSTF3Q12996 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSTF3Q12996 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CSTF3Q12996 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CSTF3Q12996 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CSTF3Q12996 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSTF3Q12996 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSTF3Q12996 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSTF3Q12996 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSTF3Q12996 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSTF3Q12996 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CSTF3Q12996 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSTF3Q12996 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CSTF3Q12996 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CSTF3Q12996 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CSTF3Q12996 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CSTF3Q12996 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CSTF3Q12996 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSTF3Q12996 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CSTF3Q12996 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSTF3Q12996 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSTF3Q12996 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSTF3Q12996 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CSTF3Q12996 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSTF3Q12996 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CSTF3Q12996 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSTF3Q12996 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSTF3Q12996 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSTF3Q12996 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSTF3Q12996 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSTF3Q12996 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CSTF3Q12996 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSTF3Q12996 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSTF3Q12996 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CSTF3Q12996 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSTF3Q12996 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSTF3Q12996 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CSTF3Q12996 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSTF3Q12996 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CSTF3Q12996 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CSTF3Q12996 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
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