Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
BNIP3Q12983 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BNIP3Q12983 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BNIP3Q12983 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BNIP3Q12983 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BNIP3Q12983 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BNIP3Q12983 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BNIP3Q12983 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BNIP3Q12983 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BNIP3Q12983 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BNIP3Q12983 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BNIP3Q12983 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BNIP3Q12983 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BNIP3Q12983 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BNIP3Q12983 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BNIP3Q12983 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BNIP3Q12983 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BNIP3Q12983 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BNIP3Q12983 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BNIP3Q12983 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BNIP3Q12983 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BNIP3Q12983 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BNIP3Q12983 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BNIP3Q12983 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BNIP3Q12983 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BNIP3Q12983 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BNIP3Q12983 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BNIP3Q12983 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BNIP3Q12983 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BNIP3Q12983 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BNIP3Q12983 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BNIP3Q12983 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BNIP3Q12983 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BNIP3Q12983 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BNIP3Q12983 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BNIP3Q12983 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BNIP3Q12983 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BNIP3Q12983 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BNIP3Q12983 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BNIP3Q12983 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BNIP3Q12983 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BNIP3Q12983 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BNIP3Q12983 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BNIP3Q12983 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BNIP3Q12983 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BNIP3Q12983 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BNIP3Q12983 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BNIP3Q12983 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BNIP3Q12983 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BNIP3Q12983 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BNIP3Q12983 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BNIP3Q12983 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BNIP3Q12983 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BNIP3Q12983 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BNIP3Q12983 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BNIP3Q12983 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BNIP3Q12983 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BNIP3Q12983 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BNIP3Q12983 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BNIP3Q12983 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BNIP3Q12983 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BNIP3Q12983 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BNIP3Q12983 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BNIP3Q12983 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BNIP3Q12983 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BNIP3Q12983 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BNIP3Q12983 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BNIP3Q12983 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BNIP3Q12983 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BNIP3Q12983 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BNIP3Q12983 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BNIP3Q12983 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BNIP3Q12983 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BNIP3Q12983 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BNIP3Q12983 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BNIP3Q12983 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BNIP3Q12983 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BNIP3Q12983 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BNIP3Q12983 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BNIP3Q12983 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BNIP3Q12983 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BNIP3Q12983 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BNIP3Q12983 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BNIP3Q12983 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
BNIP3Q12983 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BNIP3Q12983 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BNIP3Q12983 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BNIP3Q12983 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BNIP3Q12983 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BNIP3Q12983 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BNIP3Q12983 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BNIP3Q12983 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BNIP3Q12983 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BNIP3Q12983 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BNIP3Q12983 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BNIP3Q12983 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BNIP3Q12983 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BNIP3Q12983 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BNIP3Q12983 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BNIP3Q12983 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms