Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXF2Q12947 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXF2Q12947 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXF2Q12947 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXF2Q12947 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXF2Q12947 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXF2Q12947 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXF2Q12947 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXF2Q12947 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOXF2Q12947 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXF2Q12947 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXF2Q12947 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXF2Q12947 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXF2Q12947 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXF2Q12947 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXF2Q12947 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXF2Q12947 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXF2Q12947 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXF2Q12947 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXF2Q12947 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXF2Q12947 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXF2Q12947 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXF2Q12947 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXF2Q12947 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXF2Q12947 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXF2Q12947 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXF2Q12947 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXF2Q12947 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXF2Q12947 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXF2Q12947 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXF2Q12947 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXF2Q12947 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXF2Q12947 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXF2Q12947 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXF2Q12947 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXF2Q12947 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXF2Q12947 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXF2Q12947 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXF2Q12947 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXF2Q12947 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXF2Q12947 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXF2Q12947 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXF2Q12947 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXF2Q12947 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXF2Q12947 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXF2Q12947 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXF2Q12947 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXF2Q12947 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXF2Q12947 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXF2Q12947 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXF2Q12947 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXF2Q12947 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXF2Q12947 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXF2Q12947 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXF2Q12947 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXF2Q12947 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXF2Q12947 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXF2Q12947 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXF2Q12947 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXF2Q12947 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXF2Q12947 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXF2Q12947 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXF2Q12947 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXF2Q12947 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXF2Q12947 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXF2Q12947 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXF2Q12947 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXF2Q12947 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXF2Q12947 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXF2Q12947 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXF2Q12947 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXF2Q12947 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXF2Q12947 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXF2Q12947 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXF2Q12947 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXF2Q12947 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXF2Q12947 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXF2Q12947 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXF2Q12947 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXF2Q12947 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXF2Q12947 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXF2Q12947 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXF2Q12947 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXF2Q12947 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXF2Q12947 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXF2Q12947 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXF2Q12947 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXF2Q12947 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXF2Q12947 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXF2Q12947 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
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