Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SFSWAPQ12872 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SFSWAPQ12872 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SFSWAPQ12872 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SFSWAPQ12872 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SFSWAPQ12872 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SFSWAPQ12872 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SFSWAPQ12872 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SFSWAPQ12872 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SFSWAPQ12872 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SFSWAPQ12872 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SFSWAPQ12872 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SFSWAPQ12872 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SFSWAPQ12872 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SFSWAPQ12872 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SFSWAPQ12872 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SFSWAPQ12872 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SFSWAPQ12872 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SFSWAPQ12872 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SFSWAPQ12872 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SFSWAPQ12872 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SFSWAPQ12872 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SFSWAPQ12872 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SFSWAPQ12872 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SFSWAPQ12872 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SFSWAPQ12872 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SFSWAPQ12872 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SFSWAPQ12872 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SFSWAPQ12872 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SFSWAPQ12872 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SFSWAPQ12872 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SFSWAPQ12872 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SFSWAPQ12872 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SFSWAPQ12872 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SFSWAPQ12872 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SFSWAPQ12872 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SFSWAPQ12872 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SFSWAPQ12872 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SFSWAPQ12872 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SFSWAPQ12872 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SFSWAPQ12872 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SFSWAPQ12872 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SFSWAPQ12872 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SFSWAPQ12872 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SFSWAPQ12872 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SFSWAPQ12872 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SFSWAPQ12872 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SFSWAPQ12872 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SFSWAPQ12872 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SFSWAPQ12872 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SFSWAPQ12872 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SFSWAPQ12872 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SFSWAPQ12872 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SFSWAPQ12872 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SFSWAPQ12872 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SFSWAPQ12872 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SFSWAPQ12872 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SFSWAPQ12872 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SFSWAPQ12872 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SFSWAPQ12872 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SFSWAPQ12872 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SFSWAPQ12872 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SFSWAPQ12872 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SFSWAPQ12872 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SFSWAPQ12872 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SFSWAPQ12872 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SFSWAPQ12872 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SFSWAPQ12872 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SFSWAPQ12872 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SFSWAPQ12872 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SFSWAPQ12872 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SFSWAPQ12872 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SFSWAPQ12872 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SFSWAPQ12872 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SFSWAPQ12872 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SFSWAPQ12872 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SFSWAPQ12872 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SFSWAPQ12872 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SFSWAPQ12872 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SFSWAPQ12872 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SFSWAPQ12872 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SFSWAPQ12872 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SFSWAPQ12872 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SFSWAPQ12872 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SFSWAPQ12872 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SFSWAPQ12872 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SFSWAPQ12872 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SFSWAPQ12872 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SFSWAPQ12872 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SFSWAPQ12872 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SFSWAPQ12872 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SFSWAPQ12872 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SFSWAPQ12872 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SFSWAPQ12872 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SFSWAPQ12872 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SFSWAPQ12872 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SFSWAPQ12872 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SFSWAPQ12872 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SFSWAPQ12872 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SFSWAPQ12872 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
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