Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 YJL195CYJL195C 702 nt8.41□□□□□ -1.06
SNF8Q12483 YPR126CYPR126C 309 nt8.41□□□□□ -1.06
SNF8Q12483 CCT5YJR064W 1689 nt8.4□□□□□ -1.06
SNF8Q12483 DTR1YBR180W 1719 nt8.4□□□□□ -1.07
SNF8Q12483 MAE1YKL029C 2010 nt8.39□□□□□ -1.07
SNF8Q12483 DMA2YNL116W 1569 nt8.39□□□□□ -1.07
SNF8Q12483 RPD3YNL330C 1302 nt8.38□□□□□ -1.07
SNF8Q12483 VMA11YPL234C 495 nt8.38□□□□□ -1.07
SNF8Q12483 ADE8YDR408C 645 nt8.37□□□□□ -1.07
SNF8Q12483 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.37□□□□□ -1.07
SNF8Q12483 FUN14YAL008W 597 nt8.35□□□□□ -1.07
SNF8Q12483 OPI3YJR073C 621 nt8.35□□□□□ -1.07
SNF8Q12483 YJR114WYJR114W 393 nt8.35□□□□□ -1.07
SNF8Q12483 MDM35YKL053C-A 261 nt8.35□□□□□ -1.07
SNF8Q12483 YNR064CYNR064C 873 nt8.34□□□□□ -1.07
SNF8Q12483 YHR218WYHR218W 1812 nt8.33□□□□□ -1.08
SNF8Q12483 PSD1YNL169C 1503 nt8.33□□□□□ -1.08
SNF8Q12483 ACO2YJL200C 2370 nt8.32□□□□□ -1.08
SNF8Q12483 TVP23YDR084C 600 nt8.31□□□□□ -1.08
SNF8Q12483 YEL008WYEL008W 381 nt8.31□□□□□ -1.08
SNF8Q12483 TIM44YIL022W 1296 nt8.31□□□□□ -1.08
SNF8Q12483 ELO1YJL196C 933 nt8.31□□□□□ -1.08
SNF8Q12483 TIP1YBR067C 633 nt8.31□□□□□ -1.08
SNF8Q12483 CTI6YPL181W 1521 nt8.3□□□□□ -1.08
SNF8Q12483 SPS100YHR139C 981 nt8.3□□□□□ -1.08
SNF8Q12483 YMR262WYMR262W 942 nt8.3□□□□□ -1.08
SNF8Q12483 SNX3YOR357C 489 nt8.3□□□□□ -1.08
SNF8Q12483 IML3YBR107C 738 nt8.3□□□□□ -1.08
SNF8Q12483 YMR265CYMR265C 1386 nt8.3□□□□□ -1.08
SNF8Q12483 SUV3YPL029W 2214 nt8.3□□□□□ -1.08
SNF8Q12483 THI72YOR192C 1800 nt8.29□□□□□ -1.08
SNF8Q12483 DPL1YDR294C 1770 nt8.28□□□□□ -1.08
SNF8Q12483 KRR1YCL059C 951 nt8.28□□□□□ -1.08
SNF8Q12483 RPC31YNL151C 756 nt8.28□□□□□ -1.08
SNF8Q12483 RIM2YBR192W 1134 nt8.28□□□□□ -1.08
SNF8Q12483 SFL1YOR140W 2301 nt8.27□□□□□ -1.09
SNF8Q12483 GAL2YLR081W 1725 nt8.26□□□□□ -1.09
SNF8Q12483 KEL3YPL263C 1956 nt8.26□□□□□ -1.09
SNF8Q12483 HXT10YFL011W 1641 nt8.26□□□□□ -1.09
SNF8Q12483 MHF1YOL086W-A 273 nt8.26□□□□□ -1.09
SNF8Q12483 CYT1YOR065W 930 nt8.26□□□□□ -1.09
SNF8Q12483 HAP5YOR358W 729 nt8.26□□□□□ -1.09
SNF8Q12483 TPO4YOR273C 1980 nt8.25□□□□□ -1.09
SNF8Q12483 HEM14YER014W 1620 nt8.25□□□□□ -1.09
SNF8Q12483 SWT21YNL187W 1074 nt8.24□□□□□ -1.09
SNF8Q12483 YRF1-2YER190W 5046 nt8.24□□□□□ -1.09
SNF8Q12483 HMG2YLR450W 3138 nt8.23□□□□□ -1.09
SNF8Q12483 RPN14YGL004C 1254 nt8.21□□□□□ -1.1
SNF8Q12483 ABZ2YMR289W 1125 nt8.21□□□□□ -1.1
SNF8Q12483 YLR349WYLR349W 507 nt8.2□□□□□ -1.1
SNF8Q12483 CRC1YOR100C 984 nt8.2□□□□□ -1.1
SNF8Q12483 STE4YOR212W 1272 nt8.2□□□□□ -1.1
SNF8Q12483 AGP3YFL055W 1677 nt8.2□□□□□ -1.1
SNF8Q12483 TAF13YML098W 504 nt8.19□□□□□ -1.1
SNF8Q12483 MET1YKR069W 1782 nt8.19□□□□□ -1.1
SNF8Q12483 GTB1YDR221W 2109 nt8.18□□□□□ -1.1
SNF8Q12483 URA8YJR103W 1737 nt8.18□□□□□ -1.1
SNF8Q12483 YHL008CYHL008C 1884 nt8.18□□□□□ -1.1
SNF8Q12483 PCP1YGR101W 1041 nt8.18□□□□□ -1.1
SNF8Q12483 POT1YIL160C 1254 nt8.18□□□□□ -1.1
SNF8Q12483 snR31snR31 225 nt8.17□□□□□ -1.1
SNF8Q12483 AMF1YOR378W 1548 nt8.17□□□□□ -1.1
SNF8Q12483 LEU4YNL104C 1860 nt8.17□□□□□ -1.1
SNF8Q12483 RFC1YOR217W 2586 nt8.15□□□□□ -1.11
SNF8Q12483 NIF3YGL221C 867 nt8.13□□□□□ -1.11
SNF8Q12483 CPD1YGR247W 720 nt8.12□□□□□ -1.11
SNF8Q12483 YKL053WYKL053W 375 nt8.12□□□□□ -1.11
SNF8Q12483 KGD2YDR148C 1392 nt8.11□□□□□ -1.11
SNF8Q12483 ENO2YHR174W 1314 nt8.11□□□□□ -1.11
SNF8Q12483 INH1YDL181W 258 nt8.11□□□□□ -1.11
SNF8Q12483 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.11□□□□□ -1.11
SNF8Q12483 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.11□□□□□ -1.11
SNF8Q12483 RAD51YER095W 1203 nt8.11□□□□□ -1.11
SNF8Q12483 APS2YJR058C 444 nt8.11□□□□□ -1.11
SNF8Q12483 TUB4YLR212C 1422 nt8.11□□□□□ -1.11
SNF8Q12483 SAN1YDR143C 1833 nt8.09□□□□□ -1.11
SNF8Q12483 TPC1YGR096W 945 nt8.09□□□□□ -1.11
SNF8Q12483 GSF2YML048W 1212 nt8.09□□□□□ -1.11
SNF8Q12483 YDR467CYDR467C 327 nt8.08□□□□□ -1.12
SNF8Q12483 TOK1YJL093C 2076 nt8.07□□□□□ -1.12
SNF8Q12483 NPP2YEL016C 1482 nt8.06□□□□□ -1.12
SNF8Q12483 LEU2YCL018W 1095 nt8.06□□□□□ -1.12
SNF8Q12483 NBA1YOL070C 1506 nt8.06□□□□□ -1.12
SNF8Q12483 THI3YDL080C 1830 nt8.06□□□□□ -1.12
SNF8Q12483 RSC4YKR008W 1878 nt8.05□□□□□ -1.12
SNF8Q12483 GPM1YKL152C 744 nt8.05□□□□□ -1.12
SNF8Q12483 NAM8YHR086W 1572 nt8.05□□□□□ -1.12
SNF8Q12483 NAS2YIL007C 663 nt8.04□□□□□ -1.12
SNF8Q12483 CDD1YLR245C 429 nt8.04□□□□□ -1.12
SNF8Q12483 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.04□□□□□ -1.12
SNF8Q12483 FET5YFL041W 1869 nt8.02□□□□□ -1.12
SNF8Q12483 ADH7YCR105W 1086 nt8.02□□□□□ -1.13
SNF8Q12483 SBP1YHL034C 885 nt8.02□□□□□ -1.13
SNF8Q12483 SRP54YPR088C 1626 nt8.01□□□□□ -1.13
SNF8Q12483 GGA2YHR108W 1758 nt8.01□□□□□ -1.13
SNF8Q12483 THP3YPR045C 1413 nt8.01□□□□□ -1.13
SNF8Q12483 REX2YLR059C 810 nt8□□□□□ -1.13
SNF8Q12483 YBL095WYBL095W 813 nt8□□□□□ -1.13
SNF8Q12483 PAU15YIR041W 375 nt7.98□□□□□ -1.13
SNF8Q12483 FSH2YMR222C 672 nt7.98□□□□□ -1.13
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