Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCRN3Q0VDG4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCRN3Q0VDG4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCRN3Q0VDG4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCRN3Q0VDG4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCRN3Q0VDG4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCRN3Q0VDG4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCRN3Q0VDG4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCRN3Q0VDG4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCRN3Q0VDG4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCRN3Q0VDG4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCRN3Q0VDG4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCRN3Q0VDG4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCRN3Q0VDG4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCRN3Q0VDG4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCRN3Q0VDG4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCRN3Q0VDG4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCRN3Q0VDG4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCRN3Q0VDG4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCRN3Q0VDG4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCRN3Q0VDG4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCRN3Q0VDG4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SCRN3Q0VDG4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCRN3Q0VDG4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCRN3Q0VDG4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCRN3Q0VDG4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCRN3Q0VDG4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCRN3Q0VDG4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCRN3Q0VDG4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCRN3Q0VDG4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCRN3Q0VDG4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCRN3Q0VDG4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SCRN3Q0VDG4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCRN3Q0VDG4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCRN3Q0VDG4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCRN3Q0VDG4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCRN3Q0VDG4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCRN3Q0VDG4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCRN3Q0VDG4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCRN3Q0VDG4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCRN3Q0VDG4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCRN3Q0VDG4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCRN3Q0VDG4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCRN3Q0VDG4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCRN3Q0VDG4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCRN3Q0VDG4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCRN3Q0VDG4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCRN3Q0VDG4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCRN3Q0VDG4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCRN3Q0VDG4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCRN3Q0VDG4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCRN3Q0VDG4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCRN3Q0VDG4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCRN3Q0VDG4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCRN3Q0VDG4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCRN3Q0VDG4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCRN3Q0VDG4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCRN3Q0VDG4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCRN3Q0VDG4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCRN3Q0VDG4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCRN3Q0VDG4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCRN3Q0VDG4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCRN3Q0VDG4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCRN3Q0VDG4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCRN3Q0VDG4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCRN3Q0VDG4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCRN3Q0VDG4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SCRN3Q0VDG4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCRN3Q0VDG4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms