Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
C2orf54Q08AI8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
C2orf54Q08AI8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C2orf54Q08AI8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
C2orf54Q08AI8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
C2orf54Q08AI8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C2orf54Q08AI8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
C2orf54Q08AI8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
C2orf54Q08AI8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
C2orf54Q08AI8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
C2orf54Q08AI8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C2orf54Q08AI8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
C2orf54Q08AI8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
C2orf54Q08AI8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C2orf54Q08AI8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
C2orf54Q08AI8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C2orf54Q08AI8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C2orf54Q08AI8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C2orf54Q08AI8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
C2orf54Q08AI8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C2orf54Q08AI8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
C2orf54Q08AI8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
C2orf54Q08AI8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C2orf54Q08AI8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C2orf54Q08AI8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
C2orf54Q08AI8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C2orf54Q08AI8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C2orf54Q08AI8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C2orf54Q08AI8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C2orf54Q08AI8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
C2orf54Q08AI8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
C2orf54Q08AI8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C2orf54Q08AI8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
C2orf54Q08AI8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
C2orf54Q08AI8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
C2orf54Q08AI8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
C2orf54Q08AI8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
C2orf54Q08AI8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
C2orf54Q08AI8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C2orf54Q08AI8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C2orf54Q08AI8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
C2orf54Q08AI8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C2orf54Q08AI8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C2orf54Q08AI8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
C2orf54Q08AI8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C2orf54Q08AI8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
C2orf54Q08AI8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
C2orf54Q08AI8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C2orf54Q08AI8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C2orf54Q08AI8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
C2orf54Q08AI8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
C2orf54Q08AI8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
C2orf54Q08AI8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C2orf54Q08AI8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
C2orf54Q08AI8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C2orf54Q08AI8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
C2orf54Q08AI8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C2orf54Q08AI8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
C2orf54Q08AI8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
C2orf54Q08AI8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
C2orf54Q08AI8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C2orf54Q08AI8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C2orf54Q08AI8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
C2orf54Q08AI8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
C2orf54Q08AI8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C2orf54Q08AI8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
C2orf54Q08AI8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C2orf54Q08AI8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C2orf54Q08AI8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C2orf54Q08AI8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C2orf54Q08AI8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C2orf54Q08AI8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C2orf54Q08AI8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C2orf54Q08AI8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C2orf54Q08AI8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C2orf54Q08AI8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C2orf54Q08AI8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C2orf54Q08AI8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C2orf54Q08AI8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C2orf54Q08AI8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
C2orf54Q08AI8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C2orf54Q08AI8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C2orf54Q08AI8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C2orf54Q08AI8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C2orf54Q08AI8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C2orf54Q08AI8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C2orf54Q08AI8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C2orf54Q08AI8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C2orf54Q08AI8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C2orf54Q08AI8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C2orf54Q08AI8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C2orf54Q08AI8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C2orf54Q08AI8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C2orf54Q08AI8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C2orf54Q08AI8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
C2orf54Q08AI8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C2orf54Q08AI8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C2orf54Q08AI8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C2orf54Q08AI8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
C2orf54Q08AI8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms