Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DHX9Q08211 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DHX9Q08211 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DHX9Q08211 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DHX9Q08211 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DHX9Q08211 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
DHX9Q08211 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DHX9Q08211 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DHX9Q08211 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DHX9Q08211 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DHX9Q08211 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DHX9Q08211 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DHX9Q08211 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DHX9Q08211 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
DHX9Q08211 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DHX9Q08211 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DHX9Q08211 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DHX9Q08211 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DHX9Q08211 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DHX9Q08211 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
DHX9Q08211 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DHX9Q08211 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DHX9Q08211 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DHX9Q08211 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DHX9Q08211 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DHX9Q08211 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DHX9Q08211 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DHX9Q08211 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DHX9Q08211 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DHX9Q08211 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DHX9Q08211 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DHX9Q08211 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DHX9Q08211 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DHX9Q08211 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
DHX9Q08211 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DHX9Q08211 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DHX9Q08211 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DHX9Q08211 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
DHX9Q08211 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DHX9Q08211 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DHX9Q08211 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DHX9Q08211 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DHX9Q08211 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DHX9Q08211 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DHX9Q08211 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DHX9Q08211 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DHX9Q08211 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DHX9Q08211 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DHX9Q08211 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DHX9Q08211 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DHX9Q08211 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DHX9Q08211 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DHX9Q08211 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DHX9Q08211 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DHX9Q08211 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DHX9Q08211 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DHX9Q08211 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DHX9Q08211 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DHX9Q08211 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DHX9Q08211 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DHX9Q08211 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DHX9Q08211 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DHX9Q08211 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DHX9Q08211 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DHX9Q08211 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DHX9Q08211 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DHX9Q08211 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DHX9Q08211 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DHX9Q08211 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DHX9Q08211 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DHX9Q08211 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DHX9Q08211 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DHX9Q08211 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DHX9Q08211 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DHX9Q08211 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DHX9Q08211 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DHX9Q08211 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DHX9Q08211 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DHX9Q08211 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DHX9Q08211 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DHX9Q08211 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DHX9Q08211 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DHX9Q08211 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DHX9Q08211 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DHX9Q08211 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DHX9Q08211 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DHX9Q08211 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DHX9Q08211 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DHX9Q08211 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DHX9Q08211 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DHX9Q08211 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DHX9Q08211 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DHX9Q08211 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DHX9Q08211 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DHX9Q08211 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DHX9Q08211 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DHX9Q08211 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DHX9Q08211 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DHX9Q08211 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DHX9Q08211 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms