Protein–RNA interactions for Protein: Q07011

TNFRSF9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF9Q07011 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF9Q07011 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFRSF9Q07011 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFRSF9Q07011 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF9Q07011 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF9Q07011 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF9Q07011 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFRSF9Q07011 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFRSF9Q07011 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFRSF9Q07011 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFRSF9Q07011 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFRSF9Q07011 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFRSF9Q07011 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFRSF9Q07011 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFRSF9Q07011 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF9Q07011 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF9Q07011 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF9Q07011 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF9Q07011 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF9Q07011 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF9Q07011 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFRSF9Q07011 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFRSF9Q07011 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFRSF9Q07011 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFRSF9Q07011 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNFRSF9Q07011 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TNFRSF9Q07011 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TNFRSF9Q07011 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFRSF9Q07011 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFRSF9Q07011 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFRSF9Q07011 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFRSF9Q07011 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF9Q07011 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF9Q07011 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF9Q07011 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF9Q07011 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF9Q07011 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF9Q07011 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF9Q07011 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFRSF9Q07011 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF9Q07011 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF9Q07011 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF9Q07011 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF9Q07011 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNFRSF9Q07011 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF9Q07011 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF9Q07011 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF9Q07011 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF9Q07011 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF9Q07011 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF9Q07011 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF9Q07011 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF9Q07011 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF9Q07011 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF9Q07011 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFRSF9Q07011 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFRSF9Q07011 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF9Q07011 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF9Q07011 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFRSF9Q07011 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFRSF9Q07011 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFRSF9Q07011 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNFRSF9Q07011 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNFRSF9Q07011 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNFRSF9Q07011 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNFRSF9Q07011 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNFRSF9Q07011 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFRSF9Q07011 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFRSF9Q07011 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFRSF9Q07011 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFRSF9Q07011 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFRSF9Q07011 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFRSF9Q07011 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFRSF9Q07011 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFRSF9Q07011 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF9Q07011 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF9Q07011 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF9Q07011 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF9Q07011 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF9Q07011 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF9Q07011 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF9Q07011 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF9Q07011 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF9Q07011 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF9Q07011 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF9Q07011 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF9Q07011 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF9Q07011 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF9Q07011 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF9Q07011 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF9Q07011 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF9Q07011 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF9Q07011 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFRSF9Q07011 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFRSF9Q07011 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFRSF9Q07011 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFRSF9Q07011 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFRSF9Q07011 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFRSF9Q07011 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFRSF9Q07011 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms