Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD51Q06609 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD51Q06609 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD51Q06609 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD51Q06609 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD51Q06609 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAD51Q06609 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAD51Q06609 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAD51Q06609 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAD51Q06609 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD51Q06609 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD51Q06609 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAD51Q06609 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAD51Q06609 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAD51Q06609 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAD51Q06609 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAD51Q06609 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAD51Q06609 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAD51Q06609 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAD51Q06609 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD51Q06609 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD51Q06609 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAD51Q06609 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAD51Q06609 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RAD51Q06609 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAD51Q06609 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAD51Q06609 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAD51Q06609 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAD51Q06609 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD51Q06609 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD51Q06609 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD51Q06609 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD51Q06609 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD51Q06609 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD51Q06609 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD51Q06609 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD51Q06609 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD51Q06609 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD51Q06609 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD51Q06609 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD51Q06609 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD51Q06609 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD51Q06609 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD51Q06609 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD51Q06609 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD51Q06609 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD51Q06609 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD51Q06609 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD51Q06609 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD51Q06609 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD51Q06609 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD51Q06609 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD51Q06609 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD51Q06609 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAD51Q06609 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD51Q06609 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD51Q06609 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD51Q06609 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD51Q06609 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD51Q06609 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAD51Q06609 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAD51Q06609 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RAD51Q06609 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAD51Q06609 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAD51Q06609 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAD51Q06609 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RAD51Q06609 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD51Q06609 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD51Q06609 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD51Q06609 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD51Q06609 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD51Q06609 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD51Q06609 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD51Q06609 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD51Q06609 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAD51Q06609 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAD51Q06609 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAD51Q06609 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAD51Q06609 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD51Q06609 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAD51Q06609 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAD51Q06609 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RAD51Q06609 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAD51Q06609 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAD51Q06609 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAD51Q06609 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD51Q06609 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD51Q06609 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD51Q06609 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD51Q06609 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD51Q06609 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD51Q06609 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD51Q06609 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD51Q06609 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD51Q06609 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAD51Q06609 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD51Q06609 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD51Q06609 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD51Q06609 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD51Q06609 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms