Protein–RNA interactions for Protein: Q04228

UBX2, UBX domain-containing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX2Q04228 YER152W-AYER152W-A 567 nt10.43□□□□□ -0.74
UBX2Q04228 YPS3YLR121C 1527 nt10.42□□□□□ -0.74
UBX2Q04228 SPP2YOR148C 558 nt10.4□□□□□ -0.74
UBX2Q04228 SPT20YOL148C 1815 nt10.4□□□□□ -0.75
UBX2Q04228 ADE8YDR408C 645 nt10.39□□□□□ -0.75
UBX2Q04228 CWC15YDR163W 528 nt10.38□□□□□ -0.75
UBX2Q04228 ABZ2YMR289W 1125 nt10.38□□□□□ -0.75
UBX2Q04228 FMS1YMR020W 1527 nt10.38□□□□□ -0.75
UBX2Q04228 SPE2YOL052C 1191 nt10.37□□□□□ -0.75
UBX2Q04228 RIM8YGL045W 1629 nt10.36□□□□□ -0.75
UBX2Q04228 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt10.36□□□□□ -0.75
UBX2Q04228 BUD20YLR074C 501 nt10.36□□□□□ -0.75
UBX2Q04228 NAS2YIL007C 663 nt10.35□□□□□ -0.75
UBX2Q04228 FLX1YIL134W 936 nt10.35□□□□□ -0.75
UBX2Q04228 LYS20YDL182W 1287 nt10.34□□□□□ -0.75
UBX2Q04228 YJL067WYJL067W 351 nt10.34□□□□□ -0.75
UBX2Q04228 YMR007WYMR007W 381 nt10.34□□□□□ -0.75
UBX2Q04228 RCR1YBR005W 642 nt10.34□□□□□ -0.75
UBX2Q04228 ASP3-1YLR155C 1089 nt10.33□□□□□ -0.76
UBX2Q04228 ASP3-2YLR157C 1089 nt10.33□□□□□ -0.76
UBX2Q04228 ASP3-3YLR158C 1089 nt10.33□□□□□ -0.76
UBX2Q04228 ASP3-4YLR160C 1089 nt10.33□□□□□ -0.76
UBX2Q04228 RRT8YOL048C 1029 nt10.33□□□□□ -0.76
UBX2Q04228 HEM13YDR044W 987 nt10.32□□□□□ -0.76
UBX2Q04228 THP3YPR045C 1413 nt10.32□□□□□ -0.76
UBX2Q04228 RPC82YPR190C 1965 nt10.3□□□□□ -0.76
UBX2Q04228 SWM1YDR260C 513 nt10.3□□□□□ -0.76
UBX2Q04228 VPS62YGR141W 1404 nt10.3□□□□□ -0.76
UBX2Q04228 ENO2YHR174W 1314 nt10.3□□□□□ -0.76
UBX2Q04228 TVP23YDR084C 600 nt10.29□□□□□ -0.76
UBX2Q04228 CDD1YLR245C 429 nt10.29□□□□□ -0.76
UBX2Q04228 INA1YLR413W 2028 nt10.29□□□□□ -0.76
UBX2Q04228 YDR455CYDR455C 309 nt10.28□□□□□ -0.76
UBX2Q04228 FSH2YMR222C 672 nt10.28□□□□□ -0.76
UBX2Q04228 TAT2YOL020W 1779 nt10.27□□□□□ -0.77
UBX2Q04228 MOB1YIL106W 945 nt10.27□□□□□ -0.77
UBX2Q04228 ERG13YML126C 1476 nt10.27□□□□□ -0.77
UBX2Q04228 MAE1YKL029C 2010 nt10.26□□□□□ -0.77
UBX2Q04228 MET2YNL277W 1461 nt10.26□□□□□ -0.77
UBX2Q04228 CYC3YAL039C 810 nt10.26□□□□□ -0.77
UBX2Q04228 ADH3YMR083W 1128 nt10.26□□□□□ -0.77
UBX2Q04228 SFP1YLR403W 2052 nt10.26□□□□□ -0.77
UBX2Q04228 YGL114WYGL114W 2178 nt10.25□□□□□ -0.77
UBX2Q04228 BET2YPR176C 978 nt10.25□□□□□ -0.77
UBX2Q04228 SER2YGR208W 930 nt10.24□□□□□ -0.77
UBX2Q04228 HTS1YPR033C 1641 nt10.22□□□□□ -0.77
UBX2Q04228 PHB2YGR231C 933 nt10.21□□□□□ -0.77
UBX2Q04228 YDL086WYDL086W 822 nt10.2□□□□□ -0.78
UBX2Q04228 TPC1YGR096W 945 nt10.2□□□□□ -0.78
UBX2Q04228 ACH1YBL015W 1581 nt10.18□□□□□ -0.78
UBX2Q04228 AMF1YOR378W 1548 nt10.17□□□□□ -0.78
UBX2Q04228 OPI3YJR073C 621 nt10.17□□□□□ -0.78
UBX2Q04228 YKR012CYKR012C 378 nt10.17□□□□□ -0.78
UBX2Q04228 MUP1YGR055W 1725 nt10.16□□□□□ -0.78
UBX2Q04228 DIG1YPL049C 1359 nt10.15□□□□□ -0.78
UBX2Q04228 YOR343CYOR343C 327 nt10.15□□□□□ -0.78
UBX2Q04228 PCP1YGR101W 1041 nt10.14□□□□□ -0.79
UBX2Q04228 FCY1YPR062W 477 nt10.14□□□□□ -0.79
UBX2Q04228 TGA1tA(UGC)A 73 nt10.13□□□□□ -0.79
UBX2Q04228 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt10.13□□□□□ -0.79
UBX2Q04228 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt10.13□□□□□ -0.79
UBX2Q04228 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt10.13□□□□□ -0.79
UBX2Q04228 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt10.13□□□□□ -0.79
UBX2Q04228 RPL12BYDR418W 498 nt10.13□□□□□ -0.79
UBX2Q04228 LEU2YCL018W 1095 nt10.13□□□□□ -0.79
UBX2Q04228 AIM1YAL046C 357 nt10.12□□□□□ -0.79
UBX2Q04228 PAU21YOR394W 495 nt10.11□□□□□ -0.79
UBX2Q04228 PAU22YPL282C 495 nt10.11□□□□□ -0.79
UBX2Q04228 LSB6YJL100W 1824 nt10.1□□□□□ -0.79
UBX2Q04228 HRA1HRA1 564 nt10.1□□□□□ -0.79
UBX2Q04228 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt10.1□□□□□ -0.79
UBX2Q04228 ENO1YGR254W 1314 nt10.09□□□□□ -0.79
UBX2Q04228 NPP1YCR026C 2229 nt10.09□□□□□ -0.79
UBX2Q04228 SRP102YKL154W 735 nt10.09□□□□□ -0.79
UBX2Q04228 GRH1YDR517W 1119 nt10.08□□□□□ -0.8
UBX2Q04228 ENT4YLL038C 744 nt10.08□□□□□ -0.8
UBX2Q04228 YNR064CYNR064C 873 nt10.08□□□□□ -0.8
UBX2Q04228 YGR210CYGR210C 1236 nt10.07□□□□□ -0.8
UBX2Q04228 YLR280CYLR280C 351 nt10.06□□□□□ -0.8
UBX2Q04228 ERO1YML130C 1692 nt10.06□□□□□ -0.8
UBX2Q04228 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt10.05□□□□□ -0.8
UBX2Q04228 NAM8YHR086W 1572 nt10.05□□□□□ -0.8
UBX2Q04228 TPO4YOR273C 1980 nt10.05□□□□□ -0.8
UBX2Q04228 SDS24YBR214W 1584 nt10.04□□□□□ -0.8
UBX2Q04228 HMG2YLR450W 3138 nt10.03□□□□□ -0.8
UBX2Q04228 SAC7YDR389W 1965 nt10.01□□□□□ -0.81
UBX2Q04228 RIM2YBR192W 1134 nt10.01□□□□□ -0.81
UBX2Q04228 YLR046CYLR046C 813 nt10□□□□□ -0.81
UBX2Q04228 YOR268CYOR268C 399 nt9.99□□□□□ -0.81
UBX2Q04228 HOL1YNR055C 1761 nt9.98□□□□□ -0.81
UBX2Q04228 EMC3YKL207W 762 nt9.96□□□□□ -0.82
UBX2Q04228 REX2YLR059C 810 nt9.96□□□□□ -0.82
UBX2Q04228 ELO1YJL196C 933 nt9.95□□□□□ -0.82
UBX2Q04228 YPL108WYPL108W 507 nt9.95□□□□□ -0.82
UBX2Q04228 ILV3YJR016C 1758 nt9.95□□□□□ -0.82
UBX2Q04228 KEL3YPL263C 1956 nt9.95□□□□□ -0.82
UBX2Q04228 CCT2YIL142W 1584 nt9.94□□□□□ -0.82
UBX2Q04228 VBA3YCL069W 1377 nt9.94□□□□□ -0.82
UBX2Q04228 MRP1YDR347W 966 nt9.92□□□□□ -0.82
UBX2Q04228 YJL160CYJL160C 864 nt9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 430.1 ms