Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPARDQ03181 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPARDQ03181 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPARDQ03181 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPARDQ03181 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPARDQ03181 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPARDQ03181 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPARDQ03181 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPARDQ03181 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PPARDQ03181 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PPARDQ03181 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PPARDQ03181 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPARDQ03181 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms