Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPARDQ03181 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPARDQ03181 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPARDQ03181 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPARDQ03181 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPARDQ03181 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPARDQ03181 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPARDQ03181 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPARDQ03181 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPARDQ03181 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PPARDQ03181 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPARDQ03181 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PPARDQ03181 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PPARDQ03181 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PPARDQ03181 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PPARDQ03181 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPARDQ03181 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms