Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SP4Q02446 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SP4Q02446 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SP4Q02446 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SP4Q02446 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
SP4Q02446 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SP4Q02446 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SP4Q02446 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SP4Q02446 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SP4Q02446 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SP4Q02446 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SP4Q02446 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SP4Q02446 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SP4Q02446 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SP4Q02446 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SP4Q02446 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SP4Q02446 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SP4Q02446 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SP4Q02446 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SP4Q02446 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SP4Q02446 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SP4Q02446 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SP4Q02446 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SP4Q02446 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SP4Q02446 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SP4Q02446 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SP4Q02446 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SP4Q02446 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SP4Q02446 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SP4Q02446 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SP4Q02446 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SP4Q02446 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SP4Q02446 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SP4Q02446 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SP4Q02446 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SP4Q02446 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SP4Q02446 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SP4Q02446 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SP4Q02446 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SP4Q02446 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SP4Q02446 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SP4Q02446 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SP4Q02446 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SP4Q02446 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SP4Q02446 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SP4Q02446 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SP4Q02446 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SP4Q02446 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SP4Q02446 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SP4Q02446 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SP4Q02446 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SP4Q02446 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SP4Q02446 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SP4Q02446 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SP4Q02446 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SP4Q02446 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SP4Q02446 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SP4Q02446 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SP4Q02446 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SP4Q02446 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SP4Q02446 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SP4Q02446 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SP4Q02446 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SP4Q02446 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SP4Q02446 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SP4Q02446 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SP4Q02446 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SP4Q02446 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SP4Q02446 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SP4Q02446 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SP4Q02446 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SP4Q02446 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SP4Q02446 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SP4Q02446 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SP4Q02446 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SP4Q02446 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SP4Q02446 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SP4Q02446 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SP4Q02446 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SP4Q02446 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SP4Q02446 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SP4Q02446 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SP4Q02446 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SP4Q02446 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SP4Q02446 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SP4Q02446 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SP4Q02446 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SP4Q02446 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SP4Q02446 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SP4Q02446 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SP4Q02446 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SP4Q02446 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SP4Q02446 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SP4Q02446 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SP4Q02446 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SP4Q02446 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SP4Q02446 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SP4Q02446 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SP4Q02446 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SP4Q02446 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms