Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
POU5F1Q01860 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POU5F1Q01860 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POU5F1Q01860 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POU5F1Q01860 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
POU5F1Q01860 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POU5F1Q01860 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POU5F1Q01860 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POU5F1Q01860 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
POU5F1Q01860 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POU5F1Q01860 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POU5F1Q01860 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POU5F1Q01860 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POU5F1Q01860 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POU5F1Q01860 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POU5F1Q01860 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
POU5F1Q01860 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
POU5F1Q01860 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POU5F1Q01860 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POU5F1Q01860 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
POU5F1Q01860 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POU5F1Q01860 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POU5F1Q01860 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
POU5F1Q01860 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POU5F1Q01860 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POU5F1Q01860 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POU5F1Q01860 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POU5F1Q01860 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POU5F1Q01860 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POU5F1Q01860 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
POU5F1Q01860 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POU5F1Q01860 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POU5F1Q01860 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POU5F1Q01860 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POU5F1Q01860 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POU5F1Q01860 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POU5F1Q01860 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POU5F1Q01860 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POU5F1Q01860 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POU5F1Q01860 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
POU5F1Q01860 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POU5F1Q01860 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POU5F1Q01860 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POU5F1Q01860 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POU5F1Q01860 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POU5F1Q01860 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POU5F1Q01860 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POU5F1Q01860 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POU5F1Q01860 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POU5F1Q01860 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POU5F1Q01860 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POU5F1Q01860 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POU5F1Q01860 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POU5F1Q01860 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POU5F1Q01860 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POU5F1Q01860 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POU5F1Q01860 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POU5F1Q01860 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POU5F1Q01860 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POU5F1Q01860 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POU5F1Q01860 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POU5F1Q01860 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POU5F1Q01860 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POU5F1Q01860 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POU5F1Q01860 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
POU5F1Q01860 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POU5F1Q01860 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POU5F1Q01860 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POU5F1Q01860 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POU5F1Q01860 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POU5F1Q01860 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POU5F1Q01860 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POU5F1Q01860 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POU5F1Q01860 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
POU5F1Q01860 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POU5F1Q01860 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POU5F1Q01860 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POU5F1Q01860 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POU5F1Q01860 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
POU5F1Q01860 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POU5F1Q01860 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms