Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK6Q00534 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK6Q00534 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK6Q00534 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK6Q00534 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK6Q00534 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK6Q00534 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK6Q00534 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK6Q00534 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK6Q00534 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK6Q00534 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK6Q00534 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK6Q00534 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK6Q00534 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK6Q00534 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK6Q00534 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK6Q00534 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK6Q00534 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK6Q00534 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK6Q00534 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK6Q00534 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK6Q00534 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK6Q00534 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK6Q00534 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK6Q00534 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK6Q00534 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK6Q00534 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK6Q00534 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK6Q00534 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK6Q00534 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK6Q00534 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK6Q00534 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK6Q00534 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK6Q00534 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK6Q00534 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK6Q00534 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK6Q00534 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK6Q00534 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK6Q00534 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK6Q00534 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK6Q00534 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK6Q00534 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK6Q00534 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK6Q00534 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK6Q00534 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK6Q00534 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK6Q00534 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK6Q00534 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK6Q00534 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK6Q00534 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK6Q00534 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK6Q00534 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK6Q00534 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK6Q00534 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK6Q00534 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK6Q00534 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK6Q00534 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK6Q00534 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK6Q00534 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK6Q00534 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK6Q00534 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK6Q00534 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK6Q00534 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK6Q00534 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK6Q00534 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK6Q00534 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK6Q00534 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK6Q00534 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK6Q00534 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK6Q00534 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK6Q00534 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK6Q00534 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK6Q00534 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK6Q00534 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK6Q00534 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK6Q00534 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK6Q00534 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK6Q00534 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK6Q00534 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK6Q00534 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK6Q00534 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK6Q00534 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK6Q00534 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK6Q00534 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK6Q00534 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK6Q00534 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK6Q00534 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK6Q00534 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK6Q00534 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK6Q00534 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK6Q00534 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK6Q00534 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK6Q00534 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK6Q00534 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK6Q00534 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK6Q00534 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK6Q00534 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK6Q00534 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK6Q00534 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK6Q00534 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms