Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM3AP98173 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM3AP98173 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM3AP98173 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM3AP98173 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM3AP98173 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM3AP98173 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM3AP98173 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM3AP98173 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM3AP98173 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM3AP98173 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM3AP98173 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM3AP98173 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM3AP98173 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM3AP98173 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM3AP98173 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM3AP98173 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM3AP98173 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM3AP98173 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM3AP98173 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM3AP98173 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM3AP98173 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM3AP98173 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM3AP98173 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM3AP98173 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM3AP98173 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM3AP98173 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM3AP98173 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM3AP98173 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM3AP98173 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM3AP98173 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM3AP98173 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM3AP98173 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM3AP98173 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM3AP98173 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM3AP98173 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM3AP98173 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM3AP98173 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM3AP98173 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM3AP98173 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM3AP98173 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM3AP98173 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM3AP98173 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM3AP98173 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM3AP98173 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM3AP98173 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM3AP98173 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM3AP98173 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM3AP98173 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM3AP98173 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM3AP98173 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM3AP98173 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM3AP98173 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM3AP98173 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM3AP98173 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM3AP98173 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM3AP98173 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM3AP98173 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM3AP98173 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM3AP98173 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM3AP98173 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM3AP98173 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM3AP98173 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM3AP98173 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM3AP98173 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM3AP98173 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM3AP98173 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM3AP98173 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM3AP98173 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM3AP98173 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM3AP98173 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM3AP98173 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM3AP98173 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM3AP98173 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM3AP98173 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM3AP98173 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM3AP98173 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM3AP98173 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM3AP98173 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM3AP98173 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM3AP98173 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM3AP98173 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM3AP98173 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM3AP98173 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM3AP98173 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM3AP98173 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM3AP98173 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM3AP98173 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FAM3AP98173 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM3AP98173 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM3AP98173 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM3AP98173 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM3AP98173 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FAM3AP98173 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM3AP98173 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM3AP98173 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM3AP98173 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM3AP98173 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM3AP98173 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM3AP98173 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms