Protein–RNA interactions for Protein: P82673

MRPS35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P82673 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPS35P82673 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPS35P82673 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPS35P82673 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPS35P82673 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPS35P82673 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPS35P82673 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPS35P82673 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPS35P82673 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPS35P82673 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPS35P82673 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPS35P82673 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPS35P82673 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MRPS35P82673 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPS35P82673 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPS35P82673 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPS35P82673 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPS35P82673 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPS35P82673 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPS35P82673 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPS35P82673 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPS35P82673 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPS35P82673 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPS35P82673 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPS35P82673 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPS35P82673 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPS35P82673 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPS35P82673 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPS35P82673 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MRPS35P82673 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
MRPS35P82673 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MRPS35P82673 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPS35P82673 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPS35P82673 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPS35P82673 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPS35P82673 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPS35P82673 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPS35P82673 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPS35P82673 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPS35P82673 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPS35P82673 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPS35P82673 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPS35P82673 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPS35P82673 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPS35P82673 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPS35P82673 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPS35P82673 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPS35P82673 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPS35P82673 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPS35P82673 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPS35P82673 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPS35P82673 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPS35P82673 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPS35P82673 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPS35P82673 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPS35P82673 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPS35P82673 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPS35P82673 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPS35P82673 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPS35P82673 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPS35P82673 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPS35P82673 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPS35P82673 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPS35P82673 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPS35P82673 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPS35P82673 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPS35P82673 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPS35P82673 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPS35P82673 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPS35P82673 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPS35P82673 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPS35P82673 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPS35P82673 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPS35P82673 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPS35P82673 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPS35P82673 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPS35P82673 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPS35P82673 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPS35P82673 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPS35P82673 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPS35P82673 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPS35P82673 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPS35P82673 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPS35P82673 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPS35P82673 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPS35P82673 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPS35P82673 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MRPS35P82673 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPS35P82673 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPS35P82673 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPS35P82673 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPS35P82673 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPS35P82673 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPS35P82673 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPS35P82673 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPS35P82673 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPS35P82673 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPS35P82673 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPS35P82673 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPS35P82673 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms