Protein–RNA interactions for Protein: P80192

MAP3K9, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K9P80192 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
MAP3K9P80192 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
MAP3K9P80192 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
MAP3K9P80192 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
MAP3K9P80192 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
MAP3K9P80192 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
MAP3K9P80192 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
MAP3K9P80192 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
MAP3K9P80192 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
MAP3K9P80192 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
MAP3K9P80192 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
MAP3K9P80192 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
MAP3K9P80192 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
MAP3K9P80192 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
MAP3K9P80192 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
MAP3K9P80192 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
MAP3K9P80192 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
MAP3K9P80192 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
MAP3K9P80192 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
MAP3K9P80192 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
MAP3K9P80192 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
MAP3K9P80192 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
MAP3K9P80192 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
MAP3K9P80192 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
MAP3K9P80192 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
MAP3K9P80192 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
MAP3K9P80192 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
MAP3K9P80192 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
MAP3K9P80192 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
MAP3K9P80192 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
MAP3K9P80192 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
MAP3K9P80192 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
MAP3K9P80192 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
MAP3K9P80192 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
MAP3K9P80192 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
MAP3K9P80192 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
MAP3K9P80192 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
MAP3K9P80192 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
MAP3K9P80192 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
MAP3K9P80192 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
MAP3K9P80192 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MAP3K9P80192 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
MAP3K9P80192 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
MAP3K9P80192 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MAP3K9P80192 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
MAP3K9P80192 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
MAP3K9P80192 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MAP3K9P80192 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MAP3K9P80192 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MAP3K9P80192 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
MAP3K9P80192 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
MAP3K9P80192 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
MAP3K9P80192 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
MAP3K9P80192 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
MAP3K9P80192 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
MAP3K9P80192 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
MAP3K9P80192 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
MAP3K9P80192 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
MAP3K9P80192 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
MAP3K9P80192 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
MAP3K9P80192 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MAP3K9P80192 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
MAP3K9P80192 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
MAP3K9P80192 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
MAP3K9P80192 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
MAP3K9P80192 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
MAP3K9P80192 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
MAP3K9P80192 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MAP3K9P80192 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
MAP3K9P80192 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
MAP3K9P80192 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
MAP3K9P80192 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
MAP3K9P80192 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
MAP3K9P80192 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
MAP3K9P80192 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
MAP3K9P80192 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
MAP3K9P80192 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
MAP3K9P80192 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
MAP3K9P80192 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
MAP3K9P80192 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
MAP3K9P80192 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
MAP3K9P80192 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
MAP3K9P80192 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
MAP3K9P80192 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
MAP3K9P80192 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
MAP3K9P80192 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
MAP3K9P80192 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
MAP3K9P80192 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
MAP3K9P80192 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
MAP3K9P80192 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
MAP3K9P80192 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
MAP3K9P80192 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
MAP3K9P80192 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
MAP3K9P80192 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
MAP3K9P80192 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
MAP3K9P80192 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
MAP3K9P80192 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
MAP3K9P80192 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
MAP3K9P80192 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
MAP3K9P80192 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms