Protein–RNA interactions for Protein: P78426

NKX6-1, Homeobox protein Nkx-6.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-1P78426 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NKX6-1P78426 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX6-1P78426 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX6-1P78426 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKX6-1P78426 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX6-1P78426 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKX6-1P78426 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKX6-1P78426 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKX6-1P78426 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKX6-1P78426 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKX6-1P78426 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKX6-1P78426 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKX6-1P78426 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKX6-1P78426 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKX6-1P78426 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX6-1P78426 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX6-1P78426 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX6-1P78426 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX6-1P78426 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKX6-1P78426 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX6-1P78426 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX6-1P78426 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKX6-1P78426 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX6-1P78426 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX6-1P78426 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX6-1P78426 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX6-1P78426 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKX6-1P78426 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX6-1P78426 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX6-1P78426 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX6-1P78426 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX6-1P78426 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX6-1P78426 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKX6-1P78426 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX6-1P78426 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKX6-1P78426 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKX6-1P78426 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NKX6-1P78426 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NKX6-1P78426 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX6-1P78426 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX6-1P78426 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX6-1P78426 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX6-1P78426 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NKX6-1P78426 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX6-1P78426 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NKX6-1P78426 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX6-1P78426 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX6-1P78426 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX6-1P78426 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX6-1P78426 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX6-1P78426 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKX6-1P78426 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX6-1P78426 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX6-1P78426 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX6-1P78426 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX6-1P78426 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX6-1P78426 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX6-1P78426 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX6-1P78426 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX6-1P78426 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX6-1P78426 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX6-1P78426 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX6-1P78426 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX6-1P78426 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX6-1P78426 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX6-1P78426 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX6-1P78426 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX6-1P78426 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX6-1P78426 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX6-1P78426 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX6-1P78426 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX6-1P78426 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX6-1P78426 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX6-1P78426 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX6-1P78426 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX6-1P78426 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX6-1P78426 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX6-1P78426 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX6-1P78426 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX6-1P78426 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX6-1P78426 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX6-1P78426 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX6-1P78426 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX6-1P78426 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX6-1P78426 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX6-1P78426 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX6-1P78426 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX6-1P78426 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX6-1P78426 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX6-1P78426 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX6-1P78426 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX6-1P78426 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX6-1P78426 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX6-1P78426 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX6-1P78426 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX6-1P78426 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX6-1P78426 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX6-1P78426 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX6-1P78426 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX6-1P78426 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms