Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBB4BP68371 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBB4BP68371 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBB4BP68371 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TUBB4BP68371 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TUBB4BP68371 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TUBB4BP68371 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TUBB4BP68371 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TUBB4BP68371 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TUBB4BP68371 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TUBB4BP68371 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TUBB4BP68371 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TUBB4BP68371 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TUBB4BP68371 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TUBB4BP68371 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TUBB4BP68371 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TUBB4BP68371 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUBB4BP68371 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBB4BP68371 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBB4BP68371 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBB4BP68371 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBB4BP68371 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TUBB4BP68371 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TUBB4BP68371 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TUBB4BP68371 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TUBB4BP68371 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TUBB4BP68371 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TUBB4BP68371 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TUBB4BP68371 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TUBB4BP68371 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TUBB4BP68371 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TUBB4BP68371 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUBB4BP68371 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUBB4BP68371 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBB4BP68371 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBB4BP68371 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBB4BP68371 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBB4BP68371 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBB4BP68371 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBB4BP68371 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TUBB4BP68371 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUBB4BP68371 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUBB4BP68371 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUBB4BP68371 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBB4BP68371 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBB4BP68371 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBB4BP68371 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBB4BP68371 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBB4BP68371 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBB4BP68371 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBB4BP68371 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBB4BP68371 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBB4BP68371 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBB4BP68371 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBB4BP68371 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TUBB4BP68371 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBB4BP68371 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBB4BP68371 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBB4BP68371 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBB4BP68371 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBB4BP68371 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBB4BP68371 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBB4BP68371 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBB4BP68371 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBB4BP68371 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBB4BP68371 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBB4BP68371 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBB4BP68371 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBB4BP68371 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBB4BP68371 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUBB4BP68371 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TUBB4BP68371 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TUBB4BP68371 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TUBB4BP68371 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TUBB4BP68371 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TUBB4BP68371 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TUBB4BP68371 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TUBB4BP68371 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TUBB4BP68371 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TUBB4BP68371 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TUBB4BP68371 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TUBB4BP68371 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TUBB4BP68371 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUBB4BP68371 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBB4BP68371 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBB4BP68371 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBB4BP68371 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TUBB4BP68371 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TUBB4BP68371 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TUBB4BP68371 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TUBB4BP68371 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TUBB4BP68371 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TUBB4BP68371 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TUBB4BP68371 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBB4BP68371 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBB4BP68371 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBB4BP68371 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBB4BP68371 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TUBB4BP68371 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBB4BP68371 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms