Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS4XP62701 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS4XP62701 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPS4XP62701 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPS4XP62701 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPS4XP62701 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPS4XP62701 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPS4XP62701 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPS4XP62701 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPS4XP62701 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS4XP62701 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPS4XP62701 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS4XP62701 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS4XP62701 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS4XP62701 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPS4XP62701 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS4XP62701 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPS4XP62701 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS4XP62701 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPS4XP62701 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS4XP62701 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS4XP62701 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS4XP62701 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPS4XP62701 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS4XP62701 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPS4XP62701 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS4XP62701 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS4XP62701 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RPS4XP62701 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS4XP62701 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS4XP62701 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPS4XP62701 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPS4XP62701 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS4XP62701 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS4XP62701 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPS4XP62701 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS4XP62701 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS4XP62701 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS4XP62701 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS4XP62701 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS4XP62701 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPS4XP62701 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS4XP62701 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS4XP62701 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPS4XP62701 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS4XP62701 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPS4XP62701 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPS4XP62701 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS4XP62701 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS4XP62701 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS4XP62701 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS4XP62701 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS4XP62701 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS4XP62701 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS4XP62701 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS4XP62701 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS4XP62701 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS4XP62701 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS4XP62701 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS4XP62701 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS4XP62701 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS4XP62701 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS4XP62701 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS4XP62701 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS4XP62701 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS4XP62701 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS4XP62701 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS4XP62701 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS4XP62701 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS4XP62701 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS4XP62701 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPS4XP62701 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS4XP62701 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS4XP62701 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS4XP62701 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS4XP62701 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS4XP62701 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS4XP62701 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS4XP62701 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS4XP62701 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS4XP62701 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS4XP62701 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS4XP62701 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS4XP62701 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS4XP62701 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS4XP62701 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS4XP62701 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS4XP62701 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS4XP62701 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS4XP62701 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS4XP62701 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS4XP62701 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS4XP62701 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS4XP62701 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS4XP62701 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS4XP62701 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS4XP62701 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS4XP62701 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS4XP62701 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS4XP62701 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms