Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RHOAP61586 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHOAP61586 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHOAP61586 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHOAP61586 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHOAP61586 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHOAP61586 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHOAP61586 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RHOAP61586 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RHOAP61586 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RHOAP61586 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RHOAP61586 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHOAP61586 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHOAP61586 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHOAP61586 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RHOAP61586 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RHOAP61586 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RHOAP61586 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RHOAP61586 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHOAP61586 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHOAP61586 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHOAP61586 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RHOAP61586 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHOAP61586 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHOAP61586 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHOAP61586 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHOAP61586 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHOAP61586 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHOAP61586 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHOAP61586 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHOAP61586 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RHOAP61586 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RHOAP61586 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RHOAP61586 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RHOAP61586 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RHOAP61586 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RHOAP61586 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RHOAP61586 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RHOAP61586 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHOAP61586 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHOAP61586 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHOAP61586 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RHOAP61586 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHOAP61586 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RHOAP61586 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RHOAP61586 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RHOAP61586 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RHOAP61586 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RHOAP61586 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RHOAP61586 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RHOAP61586 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RHOAP61586 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RHOAP61586 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RHOAP61586 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHOAP61586 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHOAP61586 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHOAP61586 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RHOAP61586 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RHOAP61586 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RHOAP61586 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RHOAP61586 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHOAP61586 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHOAP61586 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHOAP61586 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHOAP61586 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHOAP61586 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHOAP61586 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHOAP61586 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RHOAP61586 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHOAP61586 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RHOAP61586 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RHOAP61586 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RHOAP61586 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHOAP61586 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHOAP61586 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHOAP61586 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHOAP61586 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RHOAP61586 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RHOAP61586 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RHOAP61586 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RHOAP61586 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RHOAP61586 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RHOAP61586 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RHOAP61586 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RHOAP61586 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RHOAP61586 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RHOAP61586 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RHOAP61586 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RHOAP61586 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RHOAP61586 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RHOAP61586 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RHOAP61586 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RHOAP61586 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RHOAP61586 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RHOAP61586 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RHOAP61586 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RHOAP61586 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RHOAP61586 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RHOAP61586 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RHOAP61586 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms