Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERV-K104P61576 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERV-K104P61576 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERV-K104P61576 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERV-K104P61576 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERV-K104P61576 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERV-K104P61576 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERV-K104P61576 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERV-K104P61576 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERV-K104P61576 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERV-K104P61576 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERV-K104P61576 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERV-K104P61576 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERV-K104P61576 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERV-K104P61576 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERV-K104P61576 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERV-K104P61576 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERV-K104P61576 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HERV-K104P61576 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERV-K104P61576 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERV-K104P61576 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERV-K104P61576 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERV-K104P61576 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERV-K104P61576 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERV-K104P61576 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERV-K104P61576 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERV-K104P61576 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HERV-K104P61576 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HERV-K104P61576 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERV-K104P61576 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERV-K104P61576 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERV-K104P61576 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERV-K104P61576 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERV-K104P61576 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERV-K104P61576 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERV-K104P61576 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERV-K104P61576 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERV-K104P61576 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERV-K104P61576 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERV-K104P61576 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERV-K104P61576 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERV-K104P61576 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERV-K104P61576 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERV-K104P61576 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HERV-K104P61576 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERV-K104P61576 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERV-K104P61576 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERV-K104P61576 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERV-K104P61576 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERV-K104P61576 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERV-K104P61576 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERV-K104P61576 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERV-K104P61576 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERV-K104P61576 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HERV-K104P61576 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERV-K104P61576 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERV-K104P61576 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERV-K104P61576 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERV-K104P61576 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERV-K104P61576 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERV-K104P61576 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HERV-K104P61576 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERV-K104P61576 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERV-K104P61576 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERV-K104P61576 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERV-K104P61576 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERV-K104P61576 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERV-K104P61576 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERV-K104P61576 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HERV-K104P61576 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERV-K104P61576 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERV-K104P61576 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERV-K104P61576 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERV-K104P61576 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERV-K104P61576 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERV-K104P61576 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERV-K104P61576 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERV-K104P61576 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERV-K104P61576 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERV-K104P61576 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERV-K104P61576 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERV-K104P61576 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERV-K104P61576 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERV-K104P61576 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERV-K104P61576 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERV-K104P61576 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERV-K104P61576 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERV-K104P61576 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERV-K104P61576 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERV-K104P61576 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HERV-K104P61576 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HERV-K104P61576 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HERV-K104P61576 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HERV-K104P61576 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERV-K104P61576 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERV-K104P61576 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERV-K104P61576 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HERV-K104P61576 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HERV-K104P61576 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HERV-K104P61576 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms