Protein–RNA interactions for Protein: P61201

COPS2, COP9 signalosome complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2P61201 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COPS2P61201 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
COPS2P61201 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COPS2P61201 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COPS2P61201 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COPS2P61201 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COPS2P61201 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COPS2P61201 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COPS2P61201 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COPS2P61201 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COPS2P61201 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COPS2P61201 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
COPS2P61201 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COPS2P61201 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COPS2P61201 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COPS2P61201 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COPS2P61201 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COPS2P61201 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
COPS2P61201 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COPS2P61201 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COPS2P61201 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COPS2P61201 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COPS2P61201 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COPS2P61201 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COPS2P61201 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COPS2P61201 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COPS2P61201 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COPS2P61201 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COPS2P61201 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COPS2P61201 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COPS2P61201 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COPS2P61201 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COPS2P61201 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COPS2P61201 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COPS2P61201 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COPS2P61201 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COPS2P61201 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COPS2P61201 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
COPS2P61201 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
COPS2P61201 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COPS2P61201 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COPS2P61201 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COPS2P61201 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COPS2P61201 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COPS2P61201 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COPS2P61201 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COPS2P61201 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COPS2P61201 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COPS2P61201 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COPS2P61201 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COPS2P61201 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
COPS2P61201 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COPS2P61201 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COPS2P61201 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COPS2P61201 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COPS2P61201 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COPS2P61201 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COPS2P61201 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COPS2P61201 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
COPS2P61201 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COPS2P61201 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COPS2P61201 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COPS2P61201 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COPS2P61201 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COPS2P61201 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COPS2P61201 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COPS2P61201 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COPS2P61201 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COPS2P61201 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COPS2P61201 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COPS2P61201 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COPS2P61201 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COPS2P61201 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COPS2P61201 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COPS2P61201 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COPS2P61201 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPS2P61201 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPS2P61201 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COPS2P61201 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COPS2P61201 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COPS2P61201 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COPS2P61201 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COPS2P61201 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COPS2P61201 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COPS2P61201 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COPS2P61201 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27■■□□□ 1.91
COPS2P61201 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27■■□□□ 1.91
COPS2P61201 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
COPS2P61201 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COPS2P61201 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COPS2P61201 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
COPS2P61201 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COPS2P61201 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COPS2P61201 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COPS2P61201 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COPS2P61201 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COPS2P61201 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COPS2P61201 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COPS2P61201 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COPS2P61201 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms