Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SNAP25P60880 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.49
SNAP25P60880 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SNAP25P60880 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SNAP25P60880 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SNAP25P60880 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SNAP25P60880 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SNAP25P60880 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SNAP25P60880 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SNAP25P60880 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SNAP25P60880 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SNAP25P60880 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SNAP25P60880 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SNAP25P60880 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SNAP25P60880 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SNAP25P60880 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SNAP25P60880 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SNAP25P60880 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SNAP25P60880 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SNAP25P60880 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SNAP25P60880 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SNAP25P60880 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SNAP25P60880 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SNAP25P60880 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SNAP25P60880 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SNAP25P60880 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SNAP25P60880 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SNAP25P60880 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SNAP25P60880 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SNAP25P60880 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SNAP25P60880 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SNAP25P60880 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SNAP25P60880 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SNAP25P60880 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SNAP25P60880 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SNAP25P60880 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SNAP25P60880 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SNAP25P60880 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SNAP25P60880 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SNAP25P60880 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SNAP25P60880 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SNAP25P60880 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SNAP25P60880 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SNAP25P60880 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SNAP25P60880 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SNAP25P60880 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SNAP25P60880 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SNAP25P60880 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SNAP25P60880 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SNAP25P60880 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SNAP25P60880 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
SNAP25P60880 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
SNAP25P60880 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
SNAP25P60880 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SNAP25P60880 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SNAP25P60880 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SNAP25P60880 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SNAP25P60880 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SNAP25P60880 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SNAP25P60880 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SNAP25P60880 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SNAP25P60880 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SNAP25P60880 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SNAP25P60880 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SNAP25P60880 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SNAP25P60880 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SNAP25P60880 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SNAP25P60880 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SNAP25P60880 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SNAP25P60880 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SNAP25P60880 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SNAP25P60880 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
SNAP25P60880 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SNAP25P60880 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SNAP25P60880 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SNAP25P60880 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SNAP25P60880 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SNAP25P60880 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SNAP25P60880 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SNAP25P60880 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SNAP25P60880 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SNAP25P60880 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SNAP25P60880 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SNAP25P60880 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SNAP25P60880 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SNAP25P60880 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SNAP25P60880 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SNAP25P60880 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SNAP25P60880 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SNAP25P60880 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SNAP25P60880 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SNAP25P60880 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SNAP25P60880 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SNAP25P60880 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SNAP25P60880 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SNAP25P60880 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SNAP25P60880 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SNAP25P60880 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SNAP25P60880 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SNAP25P60880 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms